Ribosylpyrimidine nucleosidase

ויקיפדיה:אודות/ויקיפדיה:אודות:
ויקיפדיה היא אנציקלופדיה מקוונת בחינם שכל אחד יכול לערוך, ולמיליונים כבר יש. מטרת ויקיפדיה היא להועיל לקוראים על ידי מכיל מידע על כל ענפי הידע. מתארח על ידי קרן ויקימדיה, הוא מורכב מתוכן הניתן לעריכה חופשית, שלמאמרים שלו יש גם קישורים רבים להנחות את הקוראים למידע נוסף. מאמרי ויקיפדיה, שנכתבו בשיתוף פעולה על ידי מתנדבים אנונימיים ברובם, המכונים ויקיפדים, יכולים לערוך על ידי כל מי שיש לו גישה לאינטרנט (ואשר אינו חסום כעת), למעט מקרים מוגבלים שבהם עריכה מוגבלת כדי למנוע הפרעה או ונדליזם. מאז הקמתו ב-15 בינואר 2001, הוא גדל לאתר ההתייחסות הגדול בעולם, ומושך למעלה ממיליארד מבקרים מדי חודש. לוויקיפדיה יש כיום יותר משישים ואחד מיליון מאמרים ביותר מ-300 שפות, כולל 6,723,835 מאמרים באנגלית עם 122,350 תורמים פעילים בחודש האחרון. עקרונות היסוד של ויקיפדיה מסוכמים בחמשת עמודי התווך שלה. קהילת ויקיפדיה פיתחה מדיניות והנחיות רבות, אם כי העורכים אינם צריכים להכיר אותם לפני שהם תורמים. כל אחד יכול לערוך את הטקסט, ההפניות והתמונות של ויקיפדיה. מה שכתוב חשוב יותר ממי שכותב אותו. התוכן חייב להתאים למדיניות של ויקיפדיה, לרבות להיות ניתן לאימות על ידי מקורות שפורסמו. דעות העורכים, האמונות, החוויות האישיות, המחקרים שלא נבדקו, חומרי לשון הרע והפרות זכויות יוצרים לא יישארו. התוכנה של ויקיפדיה מאפשרת ביטול קל של שגיאות, ועורכים מנוסים צופים בעריכות גרועות ומפטרלים אותן. ויקיפדיה נבדלת מאזכורים מודפסים במובנים חשובים. הוא נוצר ומתעדכן ללא הרף, ומאמרים אנציקלופדיים על אירועים חדשים מופיעים תוך דקות ולא חודשים או שנים. מכיוון שכל אחד יכול לשפר את ויקיפדיה, היא הפכה למקיפה יותר מכל אנציקלופדיה אחרת. התורמים שלה משפרים את האיכות והכמות של המאמרים ומסירים מידע שגוי, שגיאות וונדליזם. כל קורא יכול לתקן טעות או להוסיף מידע נוסף למאמרים (ראה מחקר עם ויקיפדיה). התחל פשוט בלחיצה על הלחצנים [ערוך] או [ערוך מקור] או על סמל העיפרון בחלק העליון של כל דף או קטע שאינו מוגן. ויקיפדיה בדקה את חוכמת ההמון מאז 2001 ומצאה שזה מצליח.

Ribnica_na_Pohorju/Ribnica na Pohorju:
Ribnica na Pohorju (מבוטא [ˈɾíːbnitsa na ˈpóːxɔɾju]) הוא יישוב בצפון סלובניה. זהו מקום מושבה של עיריית Ribnica na Pohorju. הוא שוכן בגבעות פוהורג'ה ממערב למאריבור. האזור הוא חלק מהאזור המסורתי של שטיריה. הוא נכלל כעת באזור הסטטיסטי של קרינתיה.
Ribnice/Ribnice:
ריבניצה הוא כפר בעיריית ורניה שבסרביה. על פי מפקד האוכלוסין של שנת 2002, הכפר מונה 471 נפשות.
ריבניק/ריבניק:
ריבניק עשוי להתייחס ל:
ריבניק,_בוסניה_הרצגובינה/ריבניק, בוסניה והרצגובינה:
ריבניק (בסרבית קירילית: Рибник) היא עירייה השוכנת ברפובליקה סרפסקה, ישות של בוסניה והרצגובינה. הוא ממוקם בחלק הדרומי של אזור Bosanska Krajina. נכון לשנת 2013, יש בה 6,048 תושבים. מקום מושבה של העירייה הוא הכפר גורנג'י ריבניק. ריבניק, הידוע בקצרה בשם Srpski Ključ (Српски Кључ), נוצר מחלק מהעירייה שלפני המלחמה של קלג'יץ' (החלק השני של העירייה שלפני המלחמה נמצא כעת בפדרציה של בוסניה והרצגובינה).
ריבניק,_בולגריה/ריבניק, בולגריה:
ריבניק, בולגריה הוא כפר בעיריית פטריץ', במחוז בלגואבגרד, בולגריה.
ריבניק,_קרואטיה/ריבניק, קרואטיה:
ריבניק הוא כפר ועירייה במחוז קרלובץ', קרואטיה. בסך הכל מתגוררים בעירייה 475 תושבים, 98.74% מהם קרואטים.
Ribnik,_Semi%C4%8D/Ribnik, Semič:
ריבניק (מבוטא [ˈɾiːbnik]; בגרמנית: Ribnik) הוא יישוב נטוש נידח בעיריית סמיץ' בדרום סלובניה.
Ribnik_(Jagodina)/Ribnik (Jagodina):
ריבניק הוא כפר בעיריית יאגודינה, סרביה. על פי מפקד האוכלוסין של 2002, הכפר מונה 304 נפשות.
Ribnik_(נהר)/ריבניק (נהר):
הריבניק (בקירילית: Рибник, מבוטא [ריב-ניק]) הוא נהר במערב בוסניה והרצגובינה. זהו יובל מים ראשי של הסאנה, שאותו הוא מאכל בכפרים סטראן וולייה של הכפר גורנג'י ריבניק, 17 ק"מ מתחת למעיינות המקור של סאנה עצמו, ומביא כמויות גדולות של מים לסאנה הצעירה עדיין. הוא בין היובלים הקצרים מבין יובלי סאנה אך יחד עם זאת בין הגדולים בנפח שהוא מזרים לסאנה הקולטת. הריבניק ידוע כדוגמת דיג זבוב מעולה והוא פופולרי בקרב דייגים ברחבי העולם.
האי ריבניק/אי ריבניק:
האי ריבניק (בבולגרית: остров Рибник, רומניזציה: ostrov Ribnik, IPA: [ˈɔstrof ˈribnik]) הוא אי מכוסה קרח ברובו בקבוצת פיט של איי ביסקו, אנטארקטיקה. אורכו של המאפיין 1 ק"מ בכיוון דרום-מערב-צפון-מזרח ורוחבו 500 מ'. האי נקרא על שם היישוב ריבניק בדרום מערב בולגריה.
ריבניקר/ריבניקר:
ריבניקאר (בסרבית: Рибникар) הוא שם משפחה סרבי. אנשים בולטים בעלי שם המשפחה כוללים: דארקו פ. ריבניקאר (1878–1914), העיתונאי הסרבי ולדיסלב פ. ריבניקר (1871–1914), עיתונאי סרבי, אחיו של דארקו ג'ארה ריבניקאר (1912–2007), סופר סרבי
ריבניץ-דמגרטן/ריבניץ-דמגרטן:
Ribnitz-Damgarten () היא עיירה במקלנבורג-וורפומרן, גרמניה, השוכנת על אגם ריבניץ (Ribnitzer See). Ribnitz-Damgarten נמצאת במערב מחוז Vorpommern-Rügen. הגבול בין האזורים ההיסטוריים של מקלנבורג ופומרניה עובר ישירות דרך העיירה; דמגרטן הוא החלק המזרחי והפומרני, וריבניץ הוא החלק המערבי והמקלנבורגי.
Ribnitz-Damgarten_(Amt)/Ribnitz-Damgarten (Amt):
Ribnitz-Damgarten הוא אמט במחוז Vorpommern-Rügen, במקלנבורג-Vorpommern, גרמניה. מקום מושבו של האמ"ט נמצא בריבניץ-דמגרטן. אמ"ט ריבניץ-דמגרטן מורכב מהעיריות הבאות: Ahrenshagen-Daskow Ribnitz-Damgarten Schlemmin Semlow
תחנת Ribnitz-Damgarten_West_West/Ribnitz-Damgarten West:
Ribnitz-Damgarten West (בגרמנית: Bahnhof Ribnitz-Damgarten West) היא תחנת רכבת בעיירה Ribnitz-Damgarten, מקלנבורג-וורפומרן, גרמניה. התחנה שוכנת על מסילת הרכבת שטרלסונד-רוסטוק ושירותי הרכבת מופעלים על ידי דויטשה באן.
Ribni%C5%A1ko_Selo/Ribniško Selo:
Ribniško Selo (מבוטא [ˈɾiːbniʃkɔ ˈsɛːlɔ]; בסלובנית: Ribniško selo) הוא יישוב מיד צפונית למאריבור בצפון מזרח סלובניה. הוא שייך לעיריית העיר מאריבור. ישנה קפלה קטנה עם מגדל פעמונים בקצה עמק קטן מצפון מזרח ליישוב הראשי. מעל מעטפת הדלת מצוין תאריך הבנייה כ-1679.
Ribnjak/Ribnjak:
Ribnjak עשוי להתייחס ל: Ribnjak, Zagreb, שכונה ופארק בזאגרב, קרואטיה Ribnjak, Novi Sad, שכונה בנובי סאד, סרביה בריכת טיבולי, בריכה בפארק טיבולי בלובליאנה, סלובניה Ribnjak, מחוז קופריבניצה-קריז'בצ'י, כפר ליד Rasinja, קרואטיה
Ribnjak,_Novi_Sad/Ribnjak, Novi Sad:
ריבנג'ק (בסרבית קירילית: Рибњак) היא שכונה קטנה של העיר נובי סאד, סרביה.
ריבנג'ק,_זאגרב/ריבנג'ק, זאגרב:
Ribnjak (מבוטא [rîbɲak]) היא שכונה במחוז Gornji Grad - Medveščak של זאגרב, קרואטיה, ישירות ממזרח לקתדרלת זאגרב. לפי מפקד האוכלוסין של 2001, היו בשכונה 2,956 תושבים; נכון לשנת 2011, האוכלוסייה הייתה 1,324. היא מרוכזת בעיקר סביב הכביש הראשי שלה מצפון לדרום, רחוב Ribnjak.ZET בכביש Ribnjak עוברים בשכונה, הנושאים קווים 8 ו-14. תחנת חשמלית ממוקמת בצומת Grškovićeva ו-Ribnjak בחלק הצפוני של השכונה. את החלק הדרומי משרתת תחנת ההעברה של החשמלית ברחוב Draškovićeva. לשכונה משרתים גם קווי אוטובוס 106, 201, 226 ו-238. כל המסלולים עוברים ברחוב זבונרניקה ודג'נובה, התוחמים את הגבול הצפוני של השכונה.
Ribnja%C4%8Dka/Ribnjačka:
Ribnjačka הוא כפר בקרואטיה.
ריבנו/ריבנו:
ריבנו (מבוטא [ˈɾiːbnɔ]) הוא יישוב בעיריית בלד במחוז קרניולה העליון בסלובניה.
ריבנובו/ריבנובו:
ריבנובו הוא כפר הררי מבודד בעיריית גרמן, במחוז בלגואבגרד, בולגריה. הוא ממוקם בחלק הדבראש של הרי רודופי בגובה 1152 מטר, 14 קילומטרים צפונית-צפון-מערבית מגארמן ו-64 קילומטרים דרומית-מזרחית לבלגואבגראד בדרך האוויר. ניתן להגיע לכפר בכביש הררי אספלט באורך 20 קילומטרים מאוגניאנובו דרך הכפרים Skrebatno ו-Osikovo.
RiboGreen/RiboGreen:
RiboGreen הוא צבע ניאון קנייני המשמש בזיהוי וכימות של חומצות גרעין, כולל RNA ו-DNA. הוא מסונתז ומשווק על ידי Molecular Probes/Invitrogen (חטיבה של Life Technologies, כיום חלק מ-Thermo Fisher Scientific) מיוג'ין, אורגון, ארצות הברית. בצורתו החופשית, RiboGreen מפגין מעט פלואורסצנטיות ובעל חתימת ספיגה זניחה. כאשר הוא נקשר לחומצות גרעין, הצבע פורח בעוצמה שלפי היצרן גדולה בכמה סדרי גודל מהצורה הלא קשורה. ניתן לזהות את הקרינה באמצעות חיישן ולכמת את חומצת הגרעין. נוכחות מזהמים חלבוניים בדגימת חומצות הגרעין לבדיקה אינה תורמת תרומה משמעותית לספיגה, ולכן מאפשרת הוספת דאוקסיריבונוקלאזים לפרוטוקול על מנת לפרק את ה-DNA, במקרים בהם מעוניינים רק בגילוי או כימות RNA.
Ribo_(רובוט)/ריבו (רובוט):
ריבו הוא הרובוט האנושי החברתי הראשון שיכול לדבר בבנגלית. Ribo נוצרה על ידי RoboSUST, קבוצת רובוטיקה של אוניברסיטת Shahjalal למדע וטכנולוגיה, בנגלדש. הצוות היה בפיקוח מוחמד זפאר איקבל. אגודת המדע הבדיוני של בנגלדש מימנה עבור ייצור הרובוט האנושי הזה ריבו. ריבו הופיע לראשונה בציבור ב-11 בדצמבר 2015 בפסטיבל מדע בדיוני שנערך בספרייה הציבורית, שחבג.
Ribo_ou_le_soleil_sauvage/Ribo ou le soleil sauvage:
Ribo ou le soleil sauvage הוא סרט שצולם בקמרון ב-1976. קופרודוקציה קנדית-קמרונית, יצא לאקרנים בשתי המדינות ב-1978.
ריבוקו/ריבוקו:
ריבוקו (סייח 1964 בקנטקי) היה סוס מירוץ גזע גזע בריטי גזעי אמריקאי. הוא ידוע בעיקר בזכות הופעותיו ב-1967 כאשר ניצח בשניים מהמרוצים האירופיים החשובים ביותר לגילאי שלוש; הדרבי האירי וסנט לגר. ריבוקו החזיק לזמן קצר בשיא כספי הפרסים בו זכה סוס מירוץ מאומן בריטי.
Ribociclib/Ribociclib:
Ribociclib, הנמכרת תחת שם המותג Kisqali, היא תרופה המשמשת לטיפול בסוגים מסוימים של סרטן השד. Ribociclib הוא מעכב קינאז. הוא פותח על ידי Novartis ו-Astex Pharmaceuticals. תופעות הלוואי הנפוצות ביותר כוללות זיהומים, רמות נמוכות של תאי דם לבנים, כאבי ראש, שיעול, בחילות (תחושת חולה), הקאות, שלשולים, עצירות, עייפות, נשירת שיער ופריחה. Ribociclib אושרה. על ידי מנהל המזון והתרופות האמריקאי (FDA) במרץ 2017, על ידי סוכנות התרופות האירופית (EMA) באוגוסט 2017, ולשימוש בשירות הבריאות הלאומי (NHS) על ידי המכון הלאומי למצוינות בבריאות וטיפול (NICE) בפברואר 2021.
ריבדון/ריבדון:
Ribodon הוא סוג נכחד של פרות ים שחי סביב דרום אמריקה (תצורת איטוזאינגו, שתוארה אז כתצורת Entrerriana, ארגנטינה, תצורת Solimões, תצורת ברזיל ו-Urumaco, Urumaco, ונצואלה) בתקופת הטורטונית (המאיון עד הואיקוריאן בעידן היונקים היבשתיים של דרום אמריקה). ). המין הסוג הוא R. limbatus. Ribodon נחשב לאב הקדמון הישיר של הסוג Trichechus שאליו משתייכים כל פרות הים המודרניות והיה האמאנטה הראשונה שהציגה טוחנות על-מספריות שהוחלפו לאורך החיים, מה שמעיד על תזונה של צמחים שוחקים. על פי ההשערה ריבודון איכלס את אזורי החוף והן באזורי מים מתוקים; עם זאת, באיזה מהשניים מקורו אינו ידוע.
ריבופלבין/ריבופלבין:
ריבופלבין, הידוע גם בשם ויטמין B2, הוא ויטמין המצוי במזון ונמכר כתוסף תזונה. זה חיוני ליצירת שני קו-אנזימים עיקריים, פלבין מונונוקלאוטיד ופלאבין אדנין דינוקלאוטיד. קו-אנזימים אלו מעורבים בחילוף החומרים של אנרגיה, בנשימה תאית ובייצור נוגדנים, כמו גם בצמיחה והתפתחות תקינים. הקו-אנזימים נדרשים גם לחילוף החומרים של ניאצין, ויטמין B6 ופולאט. ריבופלבין נקבע לטיפול בדילול הקרנית, ונלקח דרך הפה, עשוי להפחית את שכיחות כאבי הראש של מיגרנה במבוגרים. מחסור בריבופלבין הוא נדיר ולרוב מלווה במחסור של ויטמינים וחומרי מזון אחרים. זה עשוי להיות מונע או מטופל על ידי תוספי הפה או על ידי זריקות. כוויטמין מסיס במים, כל ריבופלבין הנצרך מעבר לדרישות התזונתיות אינו מאוחסן; או שהוא לא נספג או שהוא נספג ומופרש במהירות בשתן, מה שגורם לשתן להיות בעל גוון צהוב עז. מקורות טבעיים של ריבופלבין כוללים בשר, דגים ועופות, ביצים, מוצרי חלב, ירקות ירוקים, פטריות ושקדים. מדינות מסוימות דורשות הוספתו לדגנים. ריבופלבין התגלה בשנת 1920, בודד בשנת 1933, וסונתז לראשונה בשנת 1935. בצורתה המטוהרת והמוצקה, זוהי אבקה גבישית צהובה-כתומה מסיסה במים. בנוסף לתפקידו כוויטמין, הוא משמש כחומר צבע מאכל. ביוסינתזה מתרחשת בחיידקים, פטריות וצמחים, אך לא בבעלי חיים. סינתזה תעשייתית של ריבופלבין הושגה בתחילה באמצעות תהליך כימי, אך הייצור המסחרי הנוכחי מסתמך על שיטות תסיסה באמצעות זני פטריות וחיידקים מהונדסים גנטית.
אי סבילות_לתרגול_תגובתית לריבופלבין/אי סבילות לפעילות גופנית מגיבה לריבופלבין:
אי סבילות לפעילות גופנית המגיבה לריבופלבין (מחסור ב-SLC25A32) היא הפרעה נדירה הנגרמת על ידי מוטציות של הגן SLC25A32 המקודד לטרנספורטר פולאט המיטוכונדריאלי. מטופלים סובלים מאי סבילות לפעילות גופנית וייתכן ששיבשו את התפקוד המוטורי. נצפה מתאם חיובי בין תפקוד לקוי של SLC25A32 ומחסור בפלבו-אנזים המצביע על כך ש-SLC25A32 הוא למעשה מעביר FAD מיטוכונדריאלי. במחקרי עכברים, מלבד פגיעה בחמצון β ומטבוליזם של חומצות אמינו על ידי מחסור ב-FAD המיטוכונדריאלי, עוברי Slc25a32 wipeout חוו חוסר תפקוד של מערכת מחשוף הגליצין - דיהידרוליפואמיד דהידרוגנאז. חוסר תפקוד זה של דיהידרוליפואמיד דהידרוגנאז שיבש את חילוף החומרים של פחמן אחד בתיווך פולאט, מה שהוביל למחסור ב-5-methyltetrahydrofolate. טיפול בריבופלאבין, 5-formyltetrahydrofolate (חומצה פולנית) ו/או L-5-methyltetrahydrofolate (5-MTHF) עלול להוביל לתופעה דרסטית. שיפור התסמינים. Pyridoxal - 5 - Phosphate (P5P), קו-פקטור לאנזים Serine hydroxymethyltransferase, עשוי לסייע גם בהמרה של טטרה-הידרופולאט (THF) ל-5,10-Methylenetetrahydrofolate (5,10-CH2-THF) מבשר ישיר ל-L-5 -methyltetrahydrofolate (5-MTHF).
Riboflavin:NAD(P)%2B_oxidoreductase/Riboflavin:NAD(P)+ oxidoreductase:
Riboflavin:NAD(P)+ oxidoreductase עשוי להתייחס ל: Riboflavin reductase (NAD(P)H), אנזים FMN reductase, אנזים
Riboflavin_carrier_protein/Riboflavin carrier_protein:
חלבוני נשא ריבופלבין (RFCPs) יחד עם אלבומין סרום הובלה פלבין מונונוקלאוטיד (FMN) במעגל הדם. RFCPs חשובים בהריון. מחקרים מהודו זיהו חלבון נשא ריבופלבין (RCP) הקיים בביצי ציפורים (למשל, תרנגולת), הנחשב לספציפי לריבופלבין, וחיוני להתפתחות עוברית תקינה. אם חלבון זה הופך ללא יעיל (למשל, על ידי נטרול חיסוני) על ידי טיפול בציפור עם נוגדן ספציפי, אז ההתפתחות העוברית נפסקת והעובר מת. מוטנט גנטי חסר RCP הוא גם עקר. חלבון הומולוגי, אשר יכול להפוך ללא יעיל על ידי הנוגדן לחלבון נשא ריבופלבין עוף טהור, הוכח כמתרחש במספר מיני יונקים, כולל שני מיני קופים, וגם בבני אדם. מחקרים עדכניים מאוד העלו כי רמות RCP במחזור והצביעה האימונוהיסטוכימית של RCP בדגימות ביופסיה עשויות לספק סמנים חדשים לאבחון ולפרוגנוזה של סרטן השד. הפסקת הריון הוכחה על ידי נטרול חיסוני של RCP בקופים. נותרה מחלוקת מסוימת לגבי תפקידיו של RCP, עם זאת, נראה שגם קושרי הריבופלבין האחרים, הפחות ספציפיים בדם, כולל גמא-גובולינים, ממלאים תפקיד חשוב. מחקרים אלו סיפקו דוגמה מסקרנת לתפקידם של מנגנונים ספציפיים להובלת ויטמינים, שנועדו להבטיח שצורכי הויטמין של העובר המתפתח ייענו ביעילות. עדות נוספת לצרכים המיוחדים של עוברים מתפתחים סופקה על ידי ההדגמה שאנלוגים של ריבופלבין יכולים לגרום לשינויים טרטוגניים, אפילו בהיעדר נזק ניתן לזיהוי לרקמות האם.
Riboflavin_kinase/Riboflavin kinase:
באנזיולוגיה, ריבופלבין קינאז (EC 2.7.1.26) הוא אנזים המזרז את התגובה הכימית ATP + riboflavin ⇌ {\displaystyle \rightleftharpoons } ADP + FMNThus, שני הסובסטרטים של אנזים זה הם ATP וריבופלבין, בעוד ששני המוצרים שלו הם ADP ו-FMN. ריבופלבין הופך לקופקטורים פעילים קטליטית (FAD ו-FMN) על ידי הפעולות של ריבופלבין קינאז (EC 2.7.1.26), אשר הופך אותו ל-FMN, ו-FAD synthetase (EC 2.7.7.2), אשר אדניל FMN ל-FAD. לאוקריוטים יש בדרך כלל שני אנזימים נפרדים, בעוד שלרוב הפרוקריוטים יש חלבון דו-פונקציונלי יחיד שיכול לבצע את שני הזרזים, אם כי יוצאים מן הכלל מתרחשים בשני המקרים. בעוד ריבופלבין קינאז מונו-פונקציונלי איקריוטי הוא אורתולוגי לאנזים הפרוקריוטי הדו-פונקציונלי, סינתזת FAD המונו-פונקציונלית שונה מהמקבילה הפרוקריוטית שלו, ובמקום זאת קשורה למשפחת ה-PAPS-reductase. לסינתטאז FAD החיידקי שהוא חלק מהאנזים הדו-פונקציונלי יש דמיון מרחוק לנוקלאוטידיל טרנספראזות, ומכאן שהוא עשוי להיות מעורב בתגובת האדניליציה של סינתזות FAD. אנזים זה שייך למשפחת הטרנספראזות, ליתר דיוק, אלו המעבירים זרחן- המכילות קבוצות (פוספוטרנספראזות) עם קבוצת אלכוהול כמקבל. השם השיטתי של מחלקת אנזים זו הוא ATP:riboflavin 5'-phosphotransferase. אנזים זה נקרא גם פלבוקינאז. אנזים זה משתתף בחילוף החומרים של ריבופלבין. עם זאת, קינאזות ריבופלבין ארכאיות (EC 2.7.1.161) באופן כללי מנצלות CTP ולא ATP כנוקלאוטיד התורם, ומזרזת את התגובה CTP + riboflavin ⇌ {\displaystyle \rightleftharpoons } CDP + FMN Riboflavin kinase יכול להיות מבודד גם מסוגים אחרים של חיידקים , כולם בעלי תפקיד דומה אך מספר שונה של חומצות אמינו.
Riboflavin_phosphotransferase/Riboflavin phosphotransferase:
באנזיולוגיה, ריבופלאבין פוספוטרנספראז (EC 2.7.1.42) הוא אנזים המזרז את התגובה הכימית אלפא-D-גלוקוז 1-פוספט + ריבופלאבין ⇌ {\displaystyle \rightleftharpoons } D-glucose + FMNThus, שני המצעים של האנזים הזה alpha-D-glucose 1-phosphate ו-riboflavin, ואילו שני המוצרים שלו הם D-glucose ו-FMN. אנזים זה שייך למשפחת הטרנספראזות, במיוחד אלו המעבירות קבוצות המכילות זרחן (פוספוטרנספראזות) עם קבוצת אלכוהול כמקבלת. השם השיטתי של קבוצת אנזים זו הוא אלפא-D-גלוקוז-1-פוספט:ריבופלבין 5'-פוספוטרנספראז. שמות אחרים בשימוש נפוץ כוללים ריבופלאבין פוספוטרנספראז, גלוקוז-1-פוספט פוספוטרנספראז, G-1-P פוספוטרנספראז, ו-D-גלוקוז-1-פוספט: ריבופלאבין 5'-פוספוטרנספראז.
Riboflavin_reductase_(NAD(P)H)/Riboflavin reductase (NAD(P)H):
ריבופלבין רדוקטאז (NAD(P)H) (EC 1.5.1.41, NAD(P)H-FMN רדוקטאז, Fre) הוא אנזים בעל שם שיטתי ריבופלאבין:NAD(P)+ oxidoreductase. אנזים זה מזרז את התגובה הכימית הבאה מופחתת ריבופלבין + NAD(P)+ ⇌ {\displaystyle \rightleftharpoons } ריבופלאבין + NAD(P)H + H+ אנזים זה מזרז את הפחתת הפלבין המסיסים. מבנה החלבון מצביע על כך שהמנגנון האנזימטי של פלבין רדוקטאז הוא בעל אופי דו-סובסטרט-דו-תוצר3. בשל תכונותיו המבניות, האנזים אינו מסוגל לקשור גם NAD(P)H וגם פלבין בו זמנית. לכן, במנגנון המוצע הפלאבין רדוקטאז קושר תחילה את NAD(P)H ומייצב את שחרורו של הידריד3. לאחר מכן, NAD(P)+ משתחרר והמונונוקלאוטיד הפלבין נקשר לאנזים. לאחר מכן פרוטונציה נוספת כאשר ההידריד תוקף אטום חנקן על המונונוקלאוטיד הפלבין3. לבסוף, הפלבין המופחת משתחרר מפלאבין רדוקטאז. אם המנגנון הזה אכן נכון, זה מצביע על כך שהפחתת הפלאבין על ידי פלבין רדוקטאז תלויה באנזים הנקשר תחילה ל-NAD(P)H3.
Riboflavin_synthase/Riboflavin synthase:
ריבופלבין סינתאז הוא אנזים המזרז את התגובה הסופית של ביוסינתזה של ריבופלבין. הוא מזרז העברה של יחידת ארבעה פחמנים ממולקולה אחת של 6,7-דימתיל-8-ribityllumazine לאחרת, וכתוצאה מכך לסינתזה של ריבופלבין ו-5-אמינו-6-ריבטילאמינו-2,4(1H,3H)- pyrimidinedione: (2) 6,7-dimethyl-8-ribityllumazine → riboflavin + 5-amino-6-ribitylamino-2,4(1H,3H)-pyrimidinedione
Riboflavinase/Riboflavinase:
באנזיולוגיה, ריבופלווינאז (EC 3.5.99.1) הוא אנזים המזרז את התגובה הכימית ריבופלאבין + H2O ⇌ {\displaystyle \rightleftharpoons } ריביטול + לומיchromeלכן, שני המצעים של אנזים זה הם ריבופלאבין ו-H2O, בעוד ששני המוצרים שלו הם ריבופלבין ו-H2O. ולומיכרום. אנזים זה שייך למשפחת ההידרולאזים, אלו הפועלים על קשרי פחמן-חנקן שאינם קשרי פפטיד, במיוחד בתרכובות שלא סווגו אחרת בתוך EC מספר 3.5. השם השיטתי של מחלקה אנזים זו הוא ריבופלבין הידרולאז. אנזים זה משתתף בחילוף החומרים של ריבופלבין.
Ribokinase/Ribokinase:
באנזיולוגיה, ריבוקינאז (EC 2.7.1.15) הוא אנזים המזרז את התגובה הכימית ATP + d-ribose ⇌ ADP + d-ribose 5-phosphate. המוצרים הם ADP ו-d-ribose 5-phosphate. השם השיטתי של מחלקת אנזים זו הוא ATP:d-ribose 5-phosphotransferase. שמות אחרים בשימוש נפוץ כוללים deoxyribokinase, ribokinase (זרחון) ו-d-ribokinase. אנזים זה משתתף במסלול פנטוז פוספט. Ribokinase (RK) שייך למשפחת phosphofructokinase B (PfkB) של סוכר קינאזות. חברים אחרים במשפחה זו (הידועה גם כמשפחת RK) כוללים אדנוזין קינאז (AK), אינוזין-גואנוזין קינאז, פרוקטוקינז ו-1-פוספופרוקטוקינז. חברי משפחת PfkB/RK מזוהים על ידי נוכחותם של שלושה מוטיבים ברצף שמורים והפעילות האנזימטית של משפחת חלבונים זו מראה בדרך כלל תלות בנוכחות של יונים מחומשים. מוטיב ה-NXXE השמור, שהוא מאפיין ייחודי של משפחת החלבונים PfkB, מעורב בתלות יונים מחומשים. המבנים של RK ועוד כמה חלבונים ממשפחת PfK נקבעו ממספר אורגניזמים. למרות דמיון רצף נמוך בין AdK למשפחת חלבונים אחרים של PfkB, חלבונים אלה די דומים ברמות מבניות.
Riboldi/Riboldi:
ריבולדי הוא שם משפחה. אנשים בולטים בעלי שם המשפחה כוללים: אגוסטינו גאטנו ריבולדי (1839–1902), הקרדינל הקתולי האיטלקי אנטוניו ריבולדי (1923–2017), הבישוף הקתולי האיטלקי פנלופה ריבולדי (נולד ב-1986), כדורגלן איטלקי
ריבולה/ריבולה:
ריבולה הוא כפר בדרום טוסקנה, מחוז של מחוז רוקססטרדה, במחוז גרוסטו. בזמן מפקד האוכלוסין של 2001 אוכלוסייתה הסתכמה ב-2,115. בשנת 1954 התפוצץ מוקש והרג ארבעים ושלושה עובדים. התקרית דווחה על ידי לוצ'יאנו ביאנצ'ארדי וקרלו קאסולה במאמר I minatori della Maremma (הכורים של מרמה), והיווה מקור השראה לרומן La vita agra של ביאנצ'ארדי ולסרט באותו שם בבימויו של קרלו ליזאני.
Ribolla_Gialla/Riballa Gialla:
Ribolla Gialla (ידוע גם בשם Ribolla, בסלובנית: Rumena rebula, בקרואטית: Jarbola) הוא ענב יין לבן הגדל באופן הבולט ביותר באזור פריולי שבצפון מזרח איטליה. הענב נמצא גם בסלובניה שם הוא מכונה Rebula. בפריולי, הענב משגשג באזור שמסביב לרוזצו וגוריציה. בסלובניה מגדלים את הענב בצורה בולטת באזור ברדה. הענב אינו קשור לענב היין האדום פריולי Schioppettino, הידוע גם בשם Ribolla Nera. ענב Ribola Verde המעורפל והאיכותי יותר הוא גרסה שעברה מוטציה שאינה בשימוש נרחב.
Riballita/Riballita:
ריבוליטה הוא מרק לחם טוסקני 36, פנדה, דייסה או כוס לחם העשויים מלחם וירקות, לעתים קרובות משאריות. יש הרבה וריאציות אבל המרכיבים העיקריים תמיד כוללים שאריות לחם, שעועית קנליני, קייל לקינטו, כרוב וירקות זולים כמו גזר, שעועית, מנגולד, סלרי, תפוחי אדמה ובצל. פירוש שמו הוא "מבושל מחדש".: 36 לעתים קרובות הוא נאפה בסיר חרס.: 36 כמו רוב המטבח הטוסקני, למרק יש מקורות איכרים. זה נעשה במקור על ידי חימום מחדש (או הרתחה מחדש) של שאריות המינסטרונה או מרק הירקות מהיום הקודם עם לחם מיושן. כמה מקורות מתוארכים לזה מימי הביניים, כאשר המשרתים אספו תעלות לחם ספוגות מזון מסעודות האדונים הפיאודליים והבושלו. אותם לארוחות הערב שלהם.
Ribolt,_Kentucky/Ribolt, Kentucky:
ריבולט היא קהילה לא מאוגדת במחוז לואיס, במדינת קנטקי בארה"ב.
Ribomapil_Holganza_Sr./Ribomapil Holganza Sr.:
Ribomapil Estrelloso Holganza, האב (26 באפריל 1935 - 25 בינואר 2015), הידוע בכינויו Dodong Holganza, היה פעיל פיליפיני ופוליטיקאי ששימש כמנהיג האופוזיציה נגד הנשיא ה-10 של הפיליפינים פרדיננד מרקוס על מולדתו. מחוז סבו. כחבר מייסד של המפלגה הפוליטית PDP-Laban, הולגנזה היה מעורב בכמה קבוצות אופוזיציה בוויזאיאס ובמינדנאו שעזרו לאסוף תמיכה להפלת הנשיא מרקוס במהלך מהפכת כוח העם של EDSA ב-1986.
ריבון/ריבון:
ריבון (りぼん) הוא מגזין shōjo מנגה יפני שיוצא לאור על ידי Shueisha בשלישי כל חודש. הונפק לראשונה באוגוסט 1955, יריביו הם Nakayoshi ו-Ciao. זהו אחד ממגזינים הנמכרים ביותר של shōjo manga, לאחר שמכר למעלה מ-590 מיליון עותקים מאז 1978. תפוצתו הייתה במיליונים בין 1987 ל-2001, והגיעה לשיא של 2.3 מיליון בשנת 1994. בשנת 2009, תפוצת המגזין הייתה 274,167. עם זאת, בשנת 2010, התפוצה ירדה ל-243,334. הדפים מודפסים על נייר עיתון רב-צבעוני והגליונות הם לרוב באורך של יותר מ-400 עמודים. הם מופצים עם שק מלא של דברים טובים (furoku) שנעים מצעצועים קטנים ועד פתקיות צבעוניות סביב המנגה המסודרת במגזין. הקוראים יכולים לשלוח בולים עבור מתנות להזמנה בדואר (זן-אין) בחלק מהגליונות. סדרות המנגה ממגזין זה מקובצות ומתפרסמות מאוחר יותר בצורת ספר (tankōbon) תחת חותמת Ribon Mascot Comics (RMC). ריבון גם היווה השראה למספר מגזינים ספין-אוף, כולל Bessatsu Ribon (1966–1968); Ribon Comics, שמה שונה לג'וניור קומיקס (1967–1968); ריבון קומיק (1968–1971); ריבון דלוקס (1975–1978); ו-Ribon Original (1981–2006).
Ribon_Original/Ribon Original:
ריבון מקורי (ביפנית: RIBONオリジナル, בהפבורן: Ribon Orijinaru) היה מגזין shōjo מנגה יפני בהוצאת Shueisha. זה היה מגזין אחות של ריבון, והוא פורסם משנת 1981 עד 2006. לאמני מנגה חדשים וצומחים של ריבון התפרסמו לעתים קרובות סיפוריהם הקצרים הראשונים במגזין זה. לאמני המנגה המבוססים של ריבון שהיו להם ירידה בפופולריות היו גם סיפורים קצרים או סדרות קצרות ב-Ribon Original, וסיפורי צד לסדרות שרצות כעת בריבון היו גם במגזין זה. מנגה של Yonkoma שמתפרסמת בריבון רצה במקביל גם ב-Ribon Original. Ribon Original פורסם לראשונה מדי רבעון משנת 1981. הוא עבר לדו-חודשי ב-1994 ונשאר ככזה עד שהמגזין בוטל עקב מכירות גרועות. הגיליון האחרון היה גיליון יוני 2006.
Ribonomics/Ribonomics:
Ribonomics הוא המחקר של חומצות ריבונוקלאיות (RNA) הקשורות לחלבונים קושרי RNA (RBP). המונח הוצג על ידי רוברט סדרגרן ועמיתיו שהשתמשו בכלי חיפוש ביואינפורמטי כדי לגלות ריבוזימים ומוטיבים של RNA חדשים שנמצאו במקור ב-HIV. ריבונומיקה, כמו גנומיקה או פרוטאומיקה, היא הגישה בקנה מידה גדול עם תפוקה גבוהה לזיהוי תת-קבוצות של RNA על ידי הקשר שלהם לחלבונים בתאים. מכיוון ש-RNA שליח רבים (mRNA) מקושרים לתהליכים מרובים, טכניקה זו מציעה מנגנון קל לחקור את הקשר בין מערכות תוך-תאיות שונות. פרוקריוטים מווסתים יחד גנים משותפים לתהליכים תאיים באמצעות אופרון פוליציסטרוני. מאחר שתעתוק אאוקריוטי מייצר חלבונים המקודדים ל-mRNA בצורה מונו-ציסטרונית, מוצרי גנים רבים חייבים להיות מבוטאים במקביל (ראה ביטוי גנים) ומתורגמים באופן מתוזמן. RBPs נחשבים למולקולות שמארגנות את המסרים הללו פיזית וביוכימית למקומות סלולריים שונים שבהם הם עשויים להיות מתורגמים, מפורקים או מאוחסנים. לפיכך, החקר של תמלילים הקשורים ל-RBPs נחשב חשוב באאוקריוטים כמנגנון לוויסות גנים מתואם. התהליכים הביוכימיים הסבירים שגורמים לרגולציה זו הם הפירוק המהיר/המעוכב של RNA. בנוסף להשפעה על זמן מחצית החיים של RNA, סביר להניח ששיעורי התרגום משתנים על ידי אינטראקציות בין RNA לחלבון. משפחת Drosophila ELAV, משפחת Puf בשמרים וחלבוני La, Ro ו-FMR אנושיים הם דוגמאות ידועות של RBPs, המציגות את המינים והתהליכים המגוונים שאיתם קשור ויסות גנים שלאחר שעתוק.
ריבונוקלאז/ריבונוקלאז:
ריבונוקלאז (בדרך כלל מקוצר RNase) הוא סוג של נוקלאז המזרז את הפירוק של RNA לרכיבים קטנים יותר. ניתן לחלק ריבונוקלאזים לאנדוריבונוקלאזים ואקסוריבונוקלאזים, והם מורכבים ממספר תת-מחלקות בתוך מחלקות האנזימים EC 2.7 (עבור האנזימים הזרחניים) ו-3.1 (עבור האנזימים ההידרוליטיים).
Ribonuclease_(poly-(U)-specific)/Ribonuclease (poly-(U)-specific):
ריבונוקלאז (ספציפי לפולי(U)) (EC 3.1.26.9, ריבונוקלאז (ספציפי לאוראציל), אנדוריבונוקלאז ספציפי לאוראציל, RNase ספציפי לאוראציל) הוא אנזים. אנזים זה מזרז את התגובה הכימית הבאה ביקוע אנדונוקלאוליטי של פולי(U) למקטעים המסתיימים על ידי קבוצות 3'-הידרוקסי ו-5'-פוספט אנזים זה יוצר אוליגונוקלאוטידים עם אורכי שרשרת של 6 עד 12.
Ribonuclease_4/Ribonuclease 4:
Ribonuclease 4 הוא אנזים שבבני אדם מקודד על ידי הגן RNASE4.
Ribonuclease_E/Ribonuclease E:
Ribonuclease E הוא ריבונוקלאז חיידקי המשתתף בעיבוד של RNA ריבוזומלי (9S ל-5S rRNA) ובפירוק הכימי של RNA תאי בתפזורת.
Ribonuclease_F/Ribonuclease F:
Ribonuclease F (EC 3.1.27.7, ribonuclease F (E. coli)) הוא אנזים. אנזים זה מזרז את התגובה הכימית הבאה ביקוע אנדונוקלאוליטי של מבשר RNA לשניים, ומשאיר קבוצות 5'-הידרוקסי ו-3'-פוספט
Ribonuclease_H/Ribonuclease H:
Ribonuclease H (בקיצור RNase H או RNH) היא משפחה של אנזימי אנדונוקלאז שאינם ספציפיים לרצף המזרזים את הביקוע של RNA במצע RNA/DNA באמצעות מנגנון הידרוליטי. ניתן למצוא בני משפחת RNase H כמעט בכל האורגניזמים, מחיידקים לארכיאה ועד לאאוקריוטים. המשפחה מחולקת לקבוצות הקשורות אבולוציונית עם העדפות מצע שונות במקצת, המכונות ribonuclease H1 ו-H2. הגנום האנושי מקודד הן ל-H1 והן ל-H2. ריבונוקלאז אנושי H2 הוא קומפלקס הטרוטרימרי המורכב משלוש תת-יחידות, המוטציות בכל אחת מהן הן בין הגורמים הגנטיים למחלה נדירה המכונה תסמונת איקרדי-גוטירס. סוג שלישי, הקשור קשר הדוק ל-H2, נמצא רק בכמה פרוקריוטים, בעוד ש-H1 ו-H2 מופיעים בכל תחומי החיים. בנוסף, תחומים רטרו-ויראליים של ריבונוקלאז H דמויי RNase H1 מתרחשים בחלבוני טראנסקריפטאז הפוך מרובי דומיינים, המקודדים על ידי רטרו-וירוסים כגון HIV ונדרשים לשכפול ויראלי. באאוקריוטים, ribonuclease H1 מעורב בשכפול ה-DNA של הגנום המיטוכונדריאלי. גם H1 וגם H2 מעורבים במשימות תחזוקה של הגנום כגון עיבוד מבני R-loop.
Ribonuclease_II/Ribonuclease II:
Ribonuclease II עשוי להתייחס לאחד משני אנזימים: Ribonuclease T2 Exoribonuclease II
Ribonuclease_III/Ribonuclease III:
Ribonuclease III (RNase III או RNase C)(BRENDA 3.1.26.3) הוא סוג של ribonuclease המזהה dsRNA ומבקע אותו במקומות ממוקדים ספציפיים כדי להפוך אותם ל-RNA בוגרים. אנזימים אלו הם קבוצה של אנדוריבונוקלאזים המתאפיינים בדומיין הריבונוקלאז שלהם, המסומן כתחום RNase III. הם תרכובות הנמצאות בכל מקום בתא וממלאות תפקיד מרכזי במסלולים כגון סינתזה של RNA precursor, השתקת RNA ומנגנון ה-pnp autoregulation.
Ribonuclease_IV/Ribonuclease IV:
Ribonuclease IV (EC 3.1.26.6, endoribonuclease IV, poly(A)-specific ribonuclease) הוא אנזים. אנזים זה מזרז את התגובה הכימית הבאה ביקוע אנדונוקלאוליטי של פולי(A) למקטעים המסתיימים על ידי קבוצות 3'-הידרוקסי ו-5'-פוספט אנזים זה יוצר אוליגונוקלאוטידים עם אורך שרשרת ממוצע של 10.
Ribonuclease_IX/Ribonuclease IX:
ריבונוקלאז IX (EC 3.1.26.10, אנדוריבונוקלאז ספציפי לפולי(U) ופולי(C) הוא אנזים. אנזים זה מזרז את התגובה הכימית הבאה ביקוע אנדונוקלאוליטי של פולי(U) או פולי(C) למקטעים המסתיימים על ידי קבוצות 3'-הידרוקסי ו-5'-פוספט אנזים זה פועל על פולי(U) ופולי(C).
Ribonuclease_L/Ribonuclease L:
Ribonuclease L או RNase L (עבור סמוי), הידוע לפעמים בשם ribonuclease 4 או 2'-5' oligoadenylate synthetase-dependent ribonuclease, הוא ריבונוקלאז המושרה על ידי אינטרפרון (IFN) אשר, עם הפעלה, הורס את כל ה-RNA בתוך התא (שניהם תאי וגם ויראלי). RNase L הוא אנזים שבבני אדם מקודד על ידי הגן RNASEL. גן זה מקודד למרכיב של מערכת 2'-5'oligoadenylate (2'-5'A) המוסדרת באינטרפרון, המתפקדת בתפקידים האנטי-ויראליים והאנטי-פרוליפרטיביים של אינטרפרונים . RNase L מופעל על ידי דימריזציה, המתרחשת עם קישור 2'-5'A, ומביאה לביקוע של כל ה-RNA בתא. זה יכול להוביל להפעלה של MDA5, הליקאז RNA המעורב בייצור אינטרפרונים.
Ribonuclease_M5/Ribonuclease M5:
Ribonuclease M5 (EC 3.1.26.8, RNase M5, 5S ribosomal maturation nuclease, 5S ribosomal RNA maturation endonuclease) הוא אנזים. אנזים זה מזרז את התגובה הכימית הבאה ביקוע אנדונוקלאוליטי של RNA, מסיר 21 ו-42 נוקלאוטידים, בהתאמה, מ-5'- ו-3'-termini של מבשר 5S-rRNA אנזים זה הופך את מבשר 5S-rRNA מ-Bacillus subtilis ל-5S-rRNA. .
Ribonuclease_P/Ribonuclease P:
Ribonuclease P (EC 3.1.26.5, RNase P) הוא סוג של ribonuclease אשר מבקע RNA. RNase P ייחודי מ-RNases אחרים בכך שהוא ריבוזים - חומצה ריבונוקלאית הפועלת כזרז באותו אופן שבו היה אנזים מבוסס חלבון. תפקידו הוא לנתק רצף נוסף, או מבשר, של RNA על מולקולות tRNA. יתר על כן, RNase P הוא אחד משני ריבוזימים מרובים ידועים בטבע (השני הוא הריבוזום), שגילויו זיכה את סידני אלטמן ותומס צ'ך בפרס נובל בכימיה ב-1989: בשנות ה-70 גילה אלטמן את קיומו של מבשר. tRNA עם רצפים אגפים והיה הראשון שאפיין את RNase P ופעילותו בעיבוד של רצף המנהיג 5' של tRNA מבשר. ממצאים אחרונים חושפים גם של-RNase P יש פונקציה חדשה. הוכח כי RNase P גרעיני אנושי נדרש לתעתוק תקין ויעיל של RNAs קטנים שאינם מקודדים, כגון גנים tRNA, 5S rRNA, SRP RNA ו-U6 snRNA, אשר מתומללים על ידי RNA פולימראז III, אחד משלושת הגנים הגרעיניים העיקריים. פולימראזות RNA בתאים אנושיים.
Ribonuclease_P4/Ribonuclease P4:
Ribonuclease P4 (EC 3.1.26.7) הוא אנזים. אנזים זה מזרז את התגובה הכימית הבאה ביקוע אנדונוקלאוליטי של RNA, מסיר 3'-extranucleotides ממבשר tRNA
Ribonuclease_T/Ribonuclease T:
Ribonuclease T (RNase T, exonuclease T, exo T) הוא אנזים ריבונוקלאז המעורב בהבשלה של RNA העברה ו-RNA ריבוזומלי בחיידקים, כמו גם במסלולי תיקון DNA. הוא חבר במשפחת ה-DnaQ של אקסונוקלאזים ופועל באופן לא תהליכי על קצה 3' של חומצות גרעין חד-גדיליות. RNase T מסוגל לפצל גם את ה-DNA וגם את ה-RNA, עם סגוליות קיצונית של רצף המפלה את הציטוזין בקצה ה-3' של המצע.
Ribonuclease_T1/Ribonuclease T1:
Ribonuclease T1 (EC 3.1.27.3, guanyloribonuclease, Aspergillus oryzae ribonuclease, RNase N1, RNase N2, ribonuclease N3, ribonuclease U1, ribonuclease F1, ribonuclease Ch, ribonuclease, SA, ribonuclease RN, SA 2, binase, RNase Sa, guanyl -ספציפי RNase, RNase G, RNase T1, ribonuclease guaninenucleotido-2'-transferase (מחזוריות), ribonuclease N3, ribonuclease N1) הוא אנדונוקלאז פטרייתי שמבקע RNA חד-גדילי אחרי שאריות גואנין, כלומר בקצה ה-3' שלהם; הצורה הנחקרת ביותר של אנזים זה היא הגרסה שנמצאת בעובש Aspergillus oryzae. בשל הספציפיות שלו עבור גואנין, RNase T1 משמש לעתים קרובות לעיכול RNA מפוגג לפני הרצף. בדומה לריבונוקלאזים אחרים כגון ברנאז ו-RNase A, ריבונוקלאז T1 היה פופולרי למחקרי קיפול. מבחינה מבנית, ריבונוקלאז T1 הוא חלבון α+β קטן (104 חומצות אמינו) עם יריעת בטא בעלת ארבעה גדילים, אנטי מקבילה המכסה סליל אלפא ארוך. (כמעט חמש סיבובים). ל-RNase T1 שני קשרים דיסולפידים, Cys2-Cys10 ו-Cys6-Cys103, מתוכם האחרון תורם יותר ליציבות הקיפול שלו; הפחתה מלאה של שני הדיסולפידים בדרך כלל פותחת את החלבון, אם כי ניתן להציל את קיפולו עם ריכוזי מלחים גבוהים. ל-RNase T1 יש גם ארבעה פרולינים, לשניים מהם (Pro39 ו-Pro55) יש איזומרים ציס של קשרי הפפטיד X-Pro שלהם. איזומרים לא טבעיים של פרולינים אלה יכולים לעכב קיפול קונפורמטיבי באופן דרמטי, מתקפל בסולם זמן אופייני של 7,000 שניות (כמעט שעתיים) ב-10 מעלות צלזיוס ו-pH 5.
Ribonuclease_T2/Ribonuclease T2:
ריבונוקלאז T2 (EC 3.1.27.1, חומצה ריבונוקלאז, חומצה RNase, ריבונוקלאז לא ספציפי לבסיס, Escherichia coli ribonuclease I' ribonuclease PP2, Escherichia coli ribonuclease II, ריבונוקלאז לא-ספציפי לבסיס, RN, Base-ספציפי לא ספציפי לבסיס), ריבונוקלאז (לא ספציפי לבסיס), ריבונוקלאז II, ריבונוקלאז M, ריבונוקלאז N2, ריבונוקלאז PP3, ריבונוקלאז U4, ריבונוקלאז 3'-oligonucleotide hydrolase, ribonucleate nucleotidoase-2', cyclizing. RNase (לא ספציפי לבסיס), RNase II, RNase M, RNase Ms, RNase T2, ) הוא אנזים. זה סוג של אנדוריבונוקלאז. אנזים זה מזרז את התגובה הכימית הבאה ביקוע אנדונוקלאוליטי דו-שלבי לנוקלאוזיד 3'-פוספטים ו-3'-פוספוליגונוקלאוטידים עם תוצרי ביניים פוספטים 2',3'-מחזוריים
Ribonuclease_U2/Ribonuclease U2:
Ribonuclease U2 (EC 3.1.27.4, purine specific endoribonuclease, ribonuclease U3, RNase U3, RNase U2, purine-specific ribonuclease, purine specific RNase, Pleospora RNase, Trichoderma Kingi RNase III, ribonuclease) הוא אנזים (פורין). אנזים זה מזרז את התגובה הכימית הבאה ביקוע אנדונוקלאוליטי דו-שלבי לנוקלאוזיד 3'-פוספטים ו-3'-פוספוליגונוקלאוטידים המסתיימים ב-Ap או Gp עם תוצרי ביניים פוספטים 2',3'-מחזוריים
Ribonuclease_V/Ribonuclease V:
Ribonuclease V (EC 3.1.27.8, endoribonuclease V) הוא אנזים. אנזים זה מזרז את התגובה הכימית הבאה הידרוליזה של פולי(A), ויוצרים אוליגוריבונוקלאוטידים ובסופו של דבר 3'-AMP האנזים הזה גם מיידר פולי(U).
Ribonuclease_V1/Ribonuclease V1:
Ribonuclease V1 (RNase V1) הוא אנזים ריבונוקלאז המצוי בארס של הקוברה הכספית (Naja oxiana). הוא מבקע RNA דו-גדילי בצורה לא ספציפית לרצף, בדרך כלל דורש מצע של לפחות שישה נוקלאוטידים מוערמים. כמו ריבונוקלאזים רבים, האנזים דורש נוכחות של יוני מגנזיום לפעילות.
Ribonuclease_Z/Ribonuclease Z:
TRNase Z (EC 3.1.26.11, 3 tRNase, tRNA 3 endonuclease, RNase Z, 3' tRNase) הוא אנזים שבין היתר מזרז את התגובות הכרוכות בהבשלה של tRNAs. כאן, הוא מבקע באופן אנדונוקליאוליטי את ה-RNA ומסיר נוקלאוטידים מיותרים של 3' ממבשר ה-tRNA, ויוצר את קצה ה-3' של tRNAs. קבוצת 3'-הידרוקסי נשארת בקצה ה-tRNA וקבוצת 5'-פוספוריל נשארת במולקולת הקרוואן. באופן דומה, הוא מעבד מולקולות דמויות tRNA כגון mascRNA.
Ribonuclease_alpha/Ribonuclease alpha:
ריבונוקלאז אלפא (EC 3.1.26.2, 2'-O-methyl RNase) הוא אנזים. אנזים זה מזרז את התגובה הכימית הבאה ביקוע אנדונוקלאוליטי ל-5'-phosphomonoester אנזים זה ספציפי ל-RNA מתיל O.
מעכב_ריבונוקלאז/מעכב ריבונוקלאז:
מעכב ריבונוקלאז (RI) הוא חלבון חוזר גדול (~450 שיירים, ~49 kDa), חומצי (pI ~4.7), עשיר בלוצין, היוצר קומפלקסים הדוקים במיוחד עם ריבונוקלאזים מסוימים. זהו חלבון תאי עיקרי, המהווה ~0.1% מכלל החלבון הסלולרי לפי משקל, ונראה שהוא ממלא תפקיד חשוב בוויסות חייו של RNA.RI יש תכולת ציסטאין גבוהה באופן מפתיע (~6.5%, לעומת 1.7% בטיפוסים טיפוסיים חלבונים) והוא רגיש לחמצון. RI עשיר גם בלוצין (21.5%, בהשוואה ל-9% בחלבונים טיפוסיים) ונמוך במידה שווה בשאריות הידרופוביות אחרות, בפרט. ולין, איזולאוצין, מתיונין, טירוזין ופנילאלנין.
Ribonucleate_nucleotido-2%27-transferase_(cyclizing)/Ribonucleate nucleotido-2'-transferase (cyclizing):
Ribonucleate nucleotido-2'-transferase (מחזוריות) עשויה להתייחס ל: Ribonuclease T2, אנזים Bacillus subtilis ribonuclease, אנזים
Ribonucleoprotein_Networks_Analyzed_by_Mutational_Profiling/Ribonucleoprotein Networks מנותח על ידי פרופיל מוטציוני:
רשתות ריבונוקלאופרוטאין המנותחות על ידי פרופיל מוטציוני (RNP-MaP) היא אסטרטגיה לבדיקת רשתות חלבון RNA ואתרי קשירה לחלבונים ברזולוציית נוקלאוטידים. מידע על הרכבה ותפקוד RNP יכול להקל על הבנה טובה יותר של מנגנונים ביולוגיים. RNP-MaP משתמש ב-NHS-diazirine (SDA), חומר צולב הטרו-דו-פונקציונלי, כדי להקפיא חלבונים הקשורים ל-RNA במקום. לאחר היווצרות קישורי ה-RNA-חלבון, שעתוק הפוך של MaP מתבצע כדי לתמלל הפוך את ה-RNA הקשורים לחלבון, כמו גם להכניס מוטציות באתר של קישורי RNA-חלבון. תוצאות ריצוף של cDNAs חושפות מידע הן על רשתות אינטראקציה בין חלבון ל-RNA והן על אתרי קשירת חלבון.
חלקיק_ריבונוקלאופרוטאין/חלקיק ריבונוקלאופרוטאין:
חלקיק ריבונוקלאופרוטאין או RNP הוא קומפלקס שלפוחית ​​שנוצר בין RNA לחלבונים קושרי RNA (RBP). ניתן להשתמש במונח RNP מוקדי גם לציון תאים תוך תאיים המעורבים בעיבוד של תעתיקי RNA.
ריבונוקלאוזיד/ריבונוקלאוזיד:
ריבונוקלאוזיד הוא סוג של נוקלאוזיד כולל ריבוז כרכיב. דוגמה אחת לריבונוקלאוזיד היא ציטידין.
Ribonucleoside-triphosphate reductase/Ribonucleoside-triphosphate reductase:
Ribonucleoside-triphosphate reductase (EC 1.17.4.2, ribonucleotide reductase, 2'-deoxyribonucleoside-triphosphate:oxidized-thioredoxin 2'-oxidoreductase) הוא אנזים עם שם שיטתי 2'-deoxyribonucleoside-triphosphate-dioxyribonucleoside. אנזים זה מזרז את התגובה הכימית הבאה 2'-deoxyribonucleoside triphosphate + thioredoxin disulfide + H2O ⇌ {\displaystyle \rightleftharpoons } ribonucleoside triphosphate + thioredoxinRibonucleoside-triphosphate reductase דורש cobme ו- ATP coenzy.
ריבונוקלאוטיד/ריבונוקלאוטיד:
בביוכימיה, ריבונוקלאוטיד הוא נוקלאוטיד המכיל ריבוז כמרכיב הפנטוז שלו. זה נחשב למבשר מולקולרי של חומצות גרעין. נוקלאוטידים הם אבני הבניין הבסיסיות של DNA ו-RNA. ריבונוקלאוטידים עצמם הם אבני בניין מונומריים בסיסיים ל-RNA. Deoxyribonucleotides, הנוצרים על ידי הפחתת ribonucleotides עם האנזים ribonucleotide reductase (RNR), הם אבני בניין חיוניות ל-DNA. ישנם מספר הבדלים בין דאוקסיריבונוקלאוטידים של DNA לריבונוקלאוטידים של RNA. נוקלאוטידים עוקבים מקושרים זה לזה באמצעות קשרי פוספודיסטר. ריבונוקלאוטידים משמשים גם בתפקודים תאיים אחרים. מונומרים מיוחדים אלה מנוצלים הן בוויסות התא והן באיתות התא כפי שניתן לראות באדנוזין-מונופוספט (AMP). יתר על כן, ניתן להמיר ריבונוקלאוטידים לאדנוזין טריפוספט (ATP), מטבע האנרגיה באורגניזמים. ניתן להמיר ריבונוקלאוטידים לאדנוזין מונופוספט מחזורי (AMP מחזורי) כדי לווסת הורמונים גם באורגניזמים. באורגניזמים חיים, הבסיסים הנפוצים ביותר לריבונוקלאוטידים הם אדנין (A), גואנין (G), ציטוזין (C) או אורציל (U). הבסיסים החנקניים מסווגים לשתי תרכובות אב, פורין ופירימידין.
Ribonucleotide_reductase/Ribonucleotide reductase:
Ribonucleotide Reductase (RNR), הידוע גם בשם ribonucleoside diphosphate reductase (rNDP), הוא אנזים המזרז את היווצרותם של deoxyribonucleotides מ-ribonucleotides. הוא מזרז היווצרות זו על ידי הסרת קבוצת ה-2'-הידרוקסיל של טבעת הריבוז של דיפוספטים נוקלאוזידים. הפחתה זו מייצרת deoxyribonucleotides. Deoxyribonucleotides בתורם משמשים בסינתזה של DNA. התגובה המזרזת על ידי RNR נשמרת בקפדנות בכל האורגניזמים החיים. יתר על כן, RNR ממלא תפקיד קריטי בוויסות הקצב הכולל של סינתזת ה-DNA כך ש-DNA למסת התא נשמר ביחס קבוע במהלך חלוקת התא ותיקון ה-DNA. תכונה קצת יוצאת דופן של האנזים RNR היא שהוא מזרז תגובה שמתבצעת באמצעות מנגנון פעולה של רדיקלים חופשיים. המצעים ל-RNR הם ADP, GDP, CDP ו-UDP. dTDP (deoxythymidine diphosphate) מסונתז על ידי אנזים אחר (thymidylate kinase) מ-dTMP (deoxythymidine monophosphate).
מעכב_ריבונוקלאוטיד_רדוקטאז/מעכב ריבונוקלאוטיד רדוקטאז:
מעכבי ריבונוקלאוטיד רדוקטאז הם משפחה של תרופות אנטי-סרטניות המפריעות לצמיחת תאי הגידול על ידי חסימת היווצרותם של דאוקסיריבונוקלאוטידים (אבני בניין של DNA). דוגמאות כוללות: מוטקסאפין גדוליניום. hydroxyurea fludarabine, cladribine, gemcitabine, tezacitabine, ו-triapine gallium maltolate, gallium nitrateTezacitabine, Tezacitabine אנלוג נוקלאוטידים מועמד כימותרפי שנכשל בניסויים קליניים עקב רעילות על היעד (נויטרופניה חום).
ריבופורין/ריבופורין:
ריבופורינים הם גליקופרוטאין טרנסממברני בצורת כיפה הממוקמים בממברנה של הרשת האנדופלזמית המחוספסת, אך נעדרים בקרומה של הרשת האנדופלזמית החלקה. ישנם שני סוגים של ריבופורינים: ריבופורין I ו-II. אלה פועלים בקומפלקס החלבון oligosaccharyltransferase (OST) כשתי יחידות משנה שונות של הקומפלקס הנקרא. ריבופורין I ו-II נמצאים רק בתאי אוקריוט. שני סוגי הריבופורינים מפתחים תפקיד מפתח בקשירה של ריבוזומים לרשת האנדופלזמית המחוספסת וכן בתהליכים הקו-טרנסלציוניים התלויים באינטראקציה זו. התוכן של ריבופורין של הרשת האנדופלזמית המחוספס שווה למספר הסטוכיומטרי של יחידות ריבוזומליות. לכן, הדבר מעיד על החשיבות הרבה, השפע והשימור הטוב של חלבונים אלו ברשת. כתוצאה מכך, פגמים בגנים המקודדים לחלבונים אלה עלולים לגרום להפרעות מולדות ולהשלכות הרסניות; ריבופורין I ו-II מקודדים על ידי הגנים RPN1 ו-RPN2 בהתאמה. הריבופורינים מסיסים בדטרגנטים לא-יוניים כגון Triton X-100.
Riboprobe/Riboprobe:
Riboprobe, קיצור של RNA probe, הוא קטע של RNA מסומן שניתן להשתמש בו כדי לזהות mRNA מטרה או DNA במהלך הכלאה באתרו. ניתן לייצר בדיקות RNA על ידי שעתוק במבחנה של DNA משובט המוכנס בפלסמיד מתאים במורד הזרם של מקדם ויראלי. כמה וירוסים חיידקיים מקודדים לפולימראזות ה-RNA של עצמם, שהם ספציפיים מאוד למקדמי הנגיפים. באמצעות אנזימים אלה, NTPs מסומנים ותוספות המוכנסות הן בכיוון קדימה והן בכיוון הפוכה, ניתן ליצור ריבובובבי סנס והן אנטי-סנס מגן משובט. מאחר שג'יימס ווטסון ופרנסיס קריק חשפו את טבעה של הסליל הכפול של מולקולת ה-DNA (Watson & Crick, 1953), קשרי המימן בין ארבעת הבסיסים ידועים היטב: אדנין תמיד נקשר לטימין וציטוזין תמיד נקשר לגואנין. דפוס מחייב זה הוא העיקרון הבסיסי של טכנולוגיות גנטיות מודרניות. ג'וזף גאל ומרי לו פרדו פרסמו מאמר בשנת 1969 המדגים שניתן להשתמש ב-DNA ריבוזמלי מסומן רדיואקטיבי כדי לזהות את רצף ה-DNA המשלים שלו בביצת צפרדע, הידועה כחוקרים הראשונים שמשתמשים בבדיקות DNA כדי לבצע הכלאה באתרו. בדיקות RNA הוכחו כיכולות לבצע את אותה פונקציה והן בשימוש גם עם הכלאה באתרו. בדיקות צבועות פלואורסצנטיות החליפו בדיקות עם תווית רדיו בשל השיקול של בטיחות, יציבות וקלות הזיהוי. זיהוי רצף DNA דומה ל"חיפוש מחט בערימת שחת, כאשר המחט היא רצף ה-DNA המעניין וערימת השחת היא קבוצה של כרומוזומים". יכולתו של סליל ה-DNA להתנתק, להתפרק מחדש והדיוק המדהים של זיווג בסיסים מעניק ל-riboprobes את היכולת לאתר את רצף ה-DNA המשלים שלו על כרומוזומים.
ריבוק/ריבוק:
ריבוק הוא פרבר של העיר סאו טומה במדינת סאו טומה ופרינסיפה. אוכלוסייתה מונה 4,640 (מפקד 2012).
Riboque_Santana/Riboque Santana:
ריבוק סנטנה הוא יישוב במחוז קנטגלו, האי סאו טומה במדינת סאו טומה ופרינסיפה. אוכלוסייתה מונה 1,001 (מפקד 2012). הוא שוכן ישירות מדרום לסנטנה.
Ribordone/Ribordone:
ריבורדון היא קהילה (עירייה) בעיר המטרופולין של טורינו במחוז פיימונטה האיטלקית, כ-45 ק"מ צפונית-מערבית לטורינו. ב-31 בדצמבר 2004 היו בה 81 תושבים ושטח של 44.2 קמ"ר. ריבורדונה גובלת ברשויות הבאות: רונקו קנבזה, לוקאנה וספארונה.
Riboregulator/Riboregulator:
בביולוגיה מולקולרית, ריבוגולטור הוא חומצה ריבונוקלאית (RNA) המגיבה למולקולת חומצת גרעין אות על ידי זיווג בסיסים ווטסון-קריק. ריבוגולטור עשוי להגיב למולקולת אות בכל מספר דרכים כולל, תרגום (או הדחקה של תרגום) של ה-RNA לחלבון, הפעלה של ריבוזים, שחרור של RNA משתיק (siRNA), שינוי קונפורמציה ו/או קישור אחר. חומצות גרעין. Riboregulators מכילים שני תחומים קנוניים, תחום חיישנים ותחום אפקטור. תחומים אלה נמצאים גם על ריבוסוויצ'ים, אך בניגוד לריבוסוויצ'ים, תחום החיישנים קושר רק גדילי RNA או DNA משלימים בניגוד למולקולות קטנות. מכיוון שהקישור מבוסס על זיווג בסיסים, ניתן להתאים ריבוגולטור כדי להבדיל ולהגיב לרצפים גנטיים בודדים ולשילובים שלהם.
Ribose/Ribose:
ריבוז הוא סוכר ופחמימה פשוטים עם נוסחה מולקולרית C5H10O5 והרכב בצורה לינארית H−(C=O)−(CHOH)4−H. הצורה הטבעית, d-ribose, היא מרכיב של הריבונוקלאוטידים שמהם בנוי RNA, ולכן תרכובת זו נחוצה לקידוד, פענוח, ויסות וביטוי של גנים. יש לו אנלוגי מבני, deoxyribose, שהוא מרכיב חיוני בדומה ל-DNA. l-ribose הוא סוכר לא טבעי שהוכן לראשונה על ידי אמיל פישר ואוסקר פיילוטי בשנת 1891. רק ב-1909 זיהו פיבוס לוון ו-וולטר ג'ייקובס שד-ריבוז הוא מוצר טבעי, האנטיומר של המוצר של פישר ופיילוטי, וכן מרכיב חיוני של חומצות גרעין. פישר בחר בשם "ריבוז" כיוון שהוא סידור מחדש חלקי של שמו של סוכר אחר, ארבינוז, שהריבוז שלו הוא אפימר בפחמן 2'; שני השמות מתייחסים גם לגומי ערבי, ממנו בודדו לראשונה ארבינוז וממנו הכינו ל-ריבוז. כמו רוב הסוכרים, ריבוז קיים כתערובת של צורות מחזוריות בשיווי משקל עם צורתו הליניארית, ואלה מתמירות בקלות, במיוחד בתמיסה מימית. השם "ריבוז" משמש בביוכימיה ובביולוגיה כדי להתייחס לכל הצורות הללו, אם כי שמות ספציפיים יותר עבור כל אחת מהן משמשים בעת הצורך. בצורתו הליניארית, ניתן לזהות את הריבוז כסוכר הפנטוז עם כל הקבוצות הפונקציונליות ההידרוקסיל שלו באותו צד בהקרנת פישר שלו. ל-d-Ribose יש קבוצות הידרוקסיל אלו בצד ימין והוא קשור לשם השיטתי (2R,3R,4R)-2,3,4,5-tetrahydroxypentanal, בעוד של-l-ribose קבוצות ההידרוקסיל שלו מופיעות ביד שמאל צד בהקרנת פישר. ציקליזציה של ריבוז מתרחשת באמצעות היווצרות ההמיאצטליות עקב התקפה על האלדהיד על ידי קבוצת ההידרוקסיל C4' לייצור צורת furanose או על ידי קבוצת הידרוקסיל C5' לייצור צורת פירנוז. בכל מקרה, קיימות שתי תוצאות גיאומטריות אפשריות, המכונות α- ו-β- והידועות בשם אנומרים, בהתאם לסטריאוכימיה באטום הפחמן ההמיאצטלי ("הפחמן האנומרי"). בטמפרטורת החדר, כ-76% מהד-ריבוז קיים בצורות פירנוז: 228 (α:β = 1:2) ו-24% בצורות הפורנוז: 228 (α:β = 1:3), עם כ-0.1 בלבד. % מהצורה הליניארית קיים. הריבונוקלאוזידים אדנוזין, ציטידין, גואנוזין ואורידין הם כולם נגזרות של β-d-ribofuranose. מינים בעלי חשיבות מטבולית הכוללים ריבוז מזרחן כוללים ADP, ATP, קו-אנזים A,: 228-229 ו-NADH. cAMP ו-cGMP משמשים כשליחים משניים בחלק ממסלולי איתות והם גם נגזרות של ריבוז. חלק הריבוז מופיע בכמה חומרים פרמצבטיים, כולל האנטיביוטיקה neomycin ו- paromomycin.
Ribose-5-phosphate_adenylyltransferase/Ribose-5-phosphate adenylyltransferase:
באנזימולוגיה, ריבוז-5-פוספט אדנילילטרנספראז (EC 2.7.7.35) הוא אנזים המזרז את התגובה הכימית ADP + D-ribose 5-phosphate ⇌ {\displaystyle \rightleftharpoons } פוספט + ADP-ribose, לפיכך, שני המצעים של זה האנזים הם ADP ו-D-ribose 5-phosphate, ואילו שני המוצרים שלו הם פוספט ו-ADP-ribose. אנזים זה שייך למשפחת הטרנספראזות, במיוחד אלו המעבירות קבוצות נוקלאוטידים המכילות זרחן (נוקלאוטידילטרנספראזות). השם השיטתי של מחלקת אנזים זו הוא ADP:D-ribose-5-phosphate adenylyltransferase. שמות אחרים בשימוש נפוץ כוללים ADP ribose phosphorylase, ו-adenosine diphosphoribose phosphorylase.
Ribose-5-phosphate_isomerase/Ribose-5-phosphate isomerase:
Ribose-5-phosphate isomerase (Rpi) המקודד על ידי הגן RPIA הוא אנזים (EC 5.3.1.6) המזרז את ההמרה בין ribose-5-phosphate (R5P) ו-ribulose-5-phosphate (Ru5P). הוא חבר בקבוצה גדולה יותר של איזומראזות המזרזות את ההמרה ההדדית של איזומרים כימיים (במקרה זה איזומרים מבניים של פנטוז). הוא ממלא תפקיד חיוני במטבוליזם ביוכימי הן במסלול הפוספט הפנטוז והן במחזור קלווין. השם השיטתי של קבוצת אנזים זו הוא D-ribose-5-phosphate aldose-ketose-isomerase.
חסר_איזומראז_ריבוז-5-פוספט/חסר איזומראז בריבוז-5-פוספט:
מחסור ב-Ribose-5-phosphate isomerase הוא הפרעה אנושית הנגרמת על ידי מוטציות ב-ribose-5-phosphate isomerase, אנזים של מסלול פנטוז פוספט. עם ארבעה חולים מאובחנים בלבד על פני תקופה של 27 שנים, מחסור ב-RPI הוא המחלה השנייה הנדירה ביותר הידועה נכון לעכשיו, כשהיא מוכה רק על ידי מצב Fields המשפיע על שלושה אנשים, קתרין וקירסטי פילדס, ואדם אחד לא ידוע.
Ribose-5-phosphate%E2%80%94ammonia_ligase/Ribose-5-phosphate-ammonia ligase:
באנזיולוגיה, ריבוז-5-פוספט-אמוניה ליגאז (EC 6.3.4.7) הוא אנזים המזרז את התגובה הכימית ATP + ribose 5-phosphate + NH3 ⇌ {\displaystyle \rightleftharpoons } ADP + פוספט + 5-phosphoribes substrates מהאנזים הזה הם ATP, ריבוז 5-פוספט ו-NH3, בעוד ש-3 התוצרים שלו הם ADP, פוספט ו-5-פוספוריבוסילאמין. אנזים זה שייך למשפחת הליגאזות, במיוחד אלו היוצרות קשרי פחמן-חנקן גנריים. השם השיטתי של מחלקה אנזים זו הוא ריבוז-5-פוספט: אמוניה ליגאז (יוצר ADP). אנזים זה משתתף בחילוף החומרים של פורין.
Ribose-phosphate_diphosphokinase/Ribose-phosphate diphosphokinase:
Ribose-phosphate diphosphokinase (או phosphoribosyl pyrophosphate synthetase או ribose-phosphate pyrophosphokinase) הוא אנזים הממיר ריבוז 5-פוספט ל-phosphoribosyl pyrophosphate (PRPP). זה מסווג תחת EC 2.7.6.1. האנזים מעורב בסינתזה של נוקלאוטידים (פורינים ופירמידינים), קו-פקטורים NAD ו-NADP וחומצות אמינו היסטידין וטריפטופן, המקשרים בין תהליכים ביו-סינתטיים אלו למסלול הפנטוז פוספט, ממנו נגזר המצע ריבוז 5-פוספט. Ribose 5-phosphate מיוצר על ידי HMP Shunt Pathway מ-Glucose-6-Phosphate. המוצר phosphoribosyl pyrophosphate פועל כמרכיב חיוני במסלול הצלת הפורין ובסינתזה דה נובו של פורינים. תפקוד לקוי של האנזים יערער בכך את חילוף החומרים של פורין. ריבוז-פוספט פירופוספוקינאז קיים בחיידקים, בצמחים ובבעלי חיים, וישנן שלוש איזופורמות של פירופוספוקינאז של ריבוז-פוספט אנושי. בבני אדם, הגנים המקודדים לאנזים נמצאים על כרומוזום X.
Ribose-seq/Ribose-seq:
Ribose-seq היא טכניקת מיפוי המשמשת במחקר גנטיקה כדי לקבוע את הפרופיל המלא של ריבונוקלאוטידים מוטבעים, במיוחד ribonucleoside monophosphates (rNMPs), ב-DNA גנומי. ריבונוקלאוטידים משובצים נחשבים לשינוי הנפוץ ביותר ב-DNA בתאים, ונוכחותם ב-DNA הגנומי יכולה להשפיע על יציבות הגנום. מכיוון שמחקרים אחרונים העלו כי ריבונוקלאוטידים ב-DNA של עכבר עשויים להשפיע על פתולוגיית המחלה, שילוב ריבונוקלאוטידים ב-DNA הגנומי הפך ליעד חשוב של מחקר גנטיקה רפואית. Ribose-seq מאפשרת למדענים לקבוע את המיקום והסוג המדויקים של ריבונוקלאוטידים ששולבו ב-DNA איקריוטי או פרוקריוטי. הטכניקה מנצלת את נוכחותן של קבוצות ההידרוקסיל הנוספות (OH) שנמצאות בקצה ה-2' של הריבונוקלאוטידים, שעלולות לעוות לערער את ה-DNA. הטכניקה פותחה באמצעות שיתוף פעולה עם קבוצת חוקרים במכון הטכנולוגי של ג'ורג'יה, כולל פרנצ'סקה סטורצ'י וקיונג דוק קו (כיום באוניברסיטת קליפורניה בסן פרנסיסקו), וג'יי הסלברת' מבית הספר לרפואה של אוניברסיטת קולורדו אנשוץ.
Ribose_1,5-bisphosphate_phosphokinase/Ribose 1,5-bisphosphate phosphokinase:
באנזיולוגיה, פוספוקינאז ריבוז 1,5-ביספוספט (EC 2.7.4.23) הוא אנזים המזרז את התגובה הכימית ATP + ריבוז 1,5-ביספוספט ⇌ {\displaystyle \rightleftharpoons } ADP + 5-פוספו-אלפא-D ריבוז 1-דיפוספט לפיכך, שני הסובסטרטים של אנזים זה הם ATP וריבוז 1,5-ביספוספט, בעוד ששני המוצרים שלו הם ADP ו-5-פוספו-אלפא-D-ריבוז 1-דיפוספט. אנזים זה שייך למשפחת הטרנספראזות, במיוחד אלו המעבירות קבוצות המכילות זרחן (פוספוטרנספראזות) עם קבוצת פוספט כמקבל. השם השיטתי של קבוצת אנזים זו הוא ATP:ribose-1,5-bisphosphate phosphotransferase. שמות אחרים בשימוש נפוץ כוללים ribose 1,5-bisphosphokinase ו- PhnN. אנזים זה משתתף במסלול פנטוז פוספט.
Ribose_1-dehydrogenase_(NADP%2B)/Ribose 1-dehydrogenase (NADP+):
באנזיולוגיה, ריבוז 1-דהידרוגנאז (NADP+) (EC 1.1.1.115) הוא אנזים המזרז את התגובה הכימית D-ribose + NADP+ + H2O ⇌ {\displaystyle \rightleftharpoons } D-ribonate + NADPH + H+שלושת המצעים מהאנזים הזה הם D-ribose, NADP+ ו- H2O, בעוד ש-3 המוצרים שלו הם D-ribonate, NADPH ו-H+. אנזים זה שייך למשפחת ה-oxidoreductases, במיוחד אלו הפועלים על קבוצת CH-OH של התורם עם NAD+ או NADP+ כמקבל. השם השיטתי של מחלקת אנזים זו הוא D-ribose:NADP+ 1-oxidoreductase. שמות אחרים בשימוש נפוץ כוללים D-ribose dehydrogenase (NADP+), NADP+-pentose-dehydrogenase ו-ribose 1-dehydrogenase (NADP+).
Ribose_5-phosphate/Ribose 5-phosphate:
Ribose 5-phosphate (R5P) הוא גם תוצר וגם תוצר של מסלול הפנטוז הפוספט. השלב האחרון של תגובות החמצון במסלול פנטוז פוספט הוא ייצור של ריבולוז 5-פוספט. בהתאם למצב הגוף, ריבולוז 5-פוספט יכול להתיזומר באופן הפיך לריבוז 5-פוספט. ריבולוז 5-פוספט יכול לחלופין לעבור סדרה של איזומריזציות כמו גם טרנסאלדולציות וטרנסקטולציות שגורמות לייצור של פוספטים פנטוזים אחרים וכן פרוקטוז 6-פוספט וגליצרלדהיד 3-פוספט (שניהם תוצרי ביניים בגליקוליזה). האנזים ribose-phosphate diphosphokinase הופך את ריבוז-5-phosphate ל-phosphoribosyl pyrophosphate.
Ribose_isomerase/Ribose isomerase:
באנזיולוגיה, ריבוז איזומראז (EC 5.3.1.20) הוא אנזים המזרז את התגובה הכימית D-ribose ⇌ {\displaystyle \rightleftharpoons } D-ribulose לפיכך, לאנזים זה יש מצע אחד, D-ribose, ומוצר אחד, D- ריבולוס. אנזים זה שייך למשפחת האיזומראזים, במיוחד אלה אוקסידודורדוקטאזים תוך-מולקולריים הממירים בין אלדוסים וקטוזים. השם השיטתי של מחלקת אנזים זו הוא D-ribose aldose-ketose-isomerase. שמות אחרים בשימוש נפוץ כוללים D-ribose isomerase, ו-D-ribose ketol-isomerase.
Ribose_repressor/Ribose repressor:
מדכא הריבוז (RbsR) הוא חלבון מדכא שעתוק קושר ל-DNA חיידקי וחבר במשפחת החלבונים LacI/GalR. ב-Escherichia coli, RbsR אחראי על ויסות הגנים המעורבים במטבוליזם D-ribose. ב-Bacillus subtilis, הוכח ש-RbsR יוצר אינטראקציה עם חלבון המכיל היסטידין (HPr), גורם אלוסטרי של החלבון LacI/GalR הקשור ל Catabolite Control Protein A (CcpA).
ריבוסיד/ריבוסיד:
ריבוזיד הוא כל גליקוזיד של ריבוז. ריבוזידים בצורה של ריבונוקלאוזידים וריבונוקלאוטידים ממלאים תפקיד חשוב בביוכימיה.
Ribosomal-protein-alanine_N-acetyltransferase/Ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase:
באנזיולוגיה, ריבוזומלי-חלבון-אלנין N-אצטילטרנספראז (EC 2.3.1.128) הוא אנזים המזרז את התגובה הכימית אצטיל-CoA + חלבון ריבוזומלי L-alanine ⇌ {\displaystyle \rightleftharpoons } CoA + חלבון ריבוזומלי N- אצטיל-L-אלנין לפיכך, שני הסובסטרטים של אנזים זה הם אצטיל-CoA וחלבון ריבוזומלי L-אלנין, בעוד ששני המוצרים שלו הם CoA וחלבון ריבוזומלי N-אצטיל-L-אלנין. אנזים זה שייך למשפחת הטרנספראזות, במיוחד אלה האצילטרנספראזות המעבירות קבוצות שאינן קבוצות אמינואציל. השם השיטתי של קבוצת אנזים זו הוא אצטיל-CoA:ריבוזומלי-חלבון-L-אלנין N-אצטילטרנספראז. אנזים זה נקרא גם חלבון ריבוזומלי S18 אצטילטרנספראז.
Ribosomal_DNA/Ribosomal DNA:
DNA ריבוזומלי (rDNA) הוא רצף DNA המקודד ל-RNA ריבוזומלי. רצפים אלה מווסתים את התחלת השעתוק וההגברה, ומכילים מקטעי spacer מתומללים וגם שאינם מתומללים. בגנום האנושי ישנם 5 כרומוזומים עם אזורי מארגן גרעין: הכרומוזומים האקרוצנטריים 13 (RNR1), 14 (RNR2), 15 (RNR3), 21 (RNR4) ו-22 (RNR5). הגנים שאחראים לקידוד תת-היחידות השונות של rRNA ממוקמים על פני מספר כרומוזומים בבני אדם. אבל הגנים המקודדים ל-rRNA נשמרים מאוד בכל התחומים, כאשר רק למספרי ההעתקים המעורבים עבור הגנים יש מספרים משתנים לכל מין. בחיידקים, ארכאים וכלורופלסטים ה-rRNA מורכב מיחידות שונות (קטנות יותר), ה-RNA הריבוזומלי הגדול (23S), ה-16S הריבוזמלי וה-5S rRNA. 16S rRNA נמצא בשימוש נרחב למחקרים פילוגנטיים.
Ribosomal_L28e_protein_family/Ribosomal L28e protein family:
משפחת חלבוני Ribosomal L28e היא משפחה של חלבונים הקשורים אבולוציונית. החברים כוללים חלבון ריבוזומלי 60S L28. ריבוזומים הם החלקיקים המזרזים סינתזת חלבון מכוונת mRNA בכל האורגניזמים. הקודונים של ה-mRNA נחשפים על הריבוזום כדי לאפשר קישור ל-tRNA. זה מוביל לשילוב של חומצות אמינו בשרשרת הפוליפפטיד הגדלה בהתאם למידע הגנטי. מונומרים נכנסים של חומצות אמינו נכנסים לאתר הריבוזומלי A בצורה של aminoacyl-tRNAs מורכבים עם גורם התארכות Tu (EF-Tu) ו-GTP. שרשרת הפוליפפטיד הגדלה, הממוקמת באתר P כפפטידיל-tRNA, מועברת לאחר מכן ל-aminoacyl-tRNA והפפטידיל-tRNA החדש, המורחב בשריד אחד, מועבר לאתר P בעזרת גורם ההתארכות G (EF- G) ו- GTP כאשר ה-tRNA המפוזר משוחרר מהריבוזום דרך אתר יציאה אחד או יותר. כ-2/3 מהמסה של הריבוזום מורכבת מ-RNA ו-1/3 מחלבון. החלבונים נקראים בהתאם ליחידת המשנה של הריבוזום שאליה הם שייכים - הקטן (S1 עד S31) והגדול (L1 עד L44). בדרך כלל הם מקשטים את ליבות ה-rRNA של יחידות המשנה. רבים מהחלבונים הריבוזומליים, במיוחד אלו של תת-היחידה הגדולה, מורכבים מתחום כדורי, חשוף פני השטח עם השלכות דמויות אצבע ארוכות הנמשכות לתוך ליבת ה-rRNA כדי לייצב את המבנה שלה. רוב החלבונים מקיימים אינטראקציה עם רכיבי RNA מרובים, לרוב מתחומים שונים. בתת-היחידה הגדולה, כ-1/3 מהנוקלאוטידים של 23S rRNA נמצאים לפחות במגע של ואן דר ואל עם חלבון, ו-L22 מקיים אינטראקציה עם כל ששת התחומים של ה-23S rRNA. החלבונים S4 ו-S7, אשר יוזמים הרכבה של rRNA 16S, ממוקמים בצמתים של חמישה וארבעה סלילי RNA, בהתאמה. בדרך זו חלבונים משמשים לארגון וייצוב המבנה השלישוני של rRNA. בעוד שהפעילויות המכריעות של פענוח והעברת פפטידים מבוססות על RNA, חלבונים ממלאים תפקיד פעיל בתפקודים שאולי התפתחו כדי לייעל את תהליך סינתזת החלבון. בנוסף לתפקודם בריבוזום, לחלבונים ריבוזומים רבים יש תפקיד כלשהו 'מחוץ' לריבוזום. חלבון ריבוזומי L28e מהווה חלק מתת-היחידה הריבוזומלית 60S. משפחה זו נמצאת באוקריוטים. בחולדה יש ​​9 או 10 עותקים של הגן L28. החלבון L28 מכיל שכפול פנימי אפשרי של 9 שאריות.
Ribosomal_RNA/Ribosomal RNA:
חומצה ריבוזומלית ריבונוקלאית (rRNA) היא סוג של RNA לא מקודד שהוא המרכיב העיקרי של הריבוזומים, החיוני לכל התאים. rRNA הוא ריבוזים שמבצע סינתזת חלבון בריבוזומים. RNA ריבוזומלי מועתק מ-DNA ריבוזומי (rDNA) ולאחר מכן נקשר לחלבונים ריבוזומים ליצירת תת-יחידות ריבוזומים קטנות וגדולות. rRNA הוא הגורם הפיזי והמכני של הריבוזום שמאלץ העברה של RNA (tRNA) ו-RNA שליח (mRNA) לעבד ולתרגם את האחרון לחלבונים. RNA ריבוזומלי הוא הצורה השלטת של RNA שנמצאת ברוב התאים; הוא מהווה כ-80% מה-RNA התאי למרות שמעולם לא תורגם לחלבונים בעצמו. ריבוזומים מורכבים מכ-60% rRNA ו-40% חלבונים ריבוזומים במסה.
Ribosomal_S15_leader/Ribosomal S15 leader:
מובילי חלבון ריבוזומי S15 מבצעים פונקציה רגולטורית חשובה בביוגנזה של ריבוזום. הם שימשו כמנגנון אוטו-וויסותי לשליטה בריכוז החלבונים הריבוזומים S15. המבנה ממוקם באזורים לא מתורגמים ב-5′ של mRNA המקודדים לחלבונים ריבוזומליים S15 (rpsO). סוגים מבניים מרובים של מובילי חלבון ריבוזומליים S15 ידועים באורגניזמים שונים. ה-E. coli ribosomal S15 leader הוא אלמנט RNA שיכול ליצור שני מבנים חלופיים המצויים בחלבון S15 הריבוזום. אחד משני המבנים החלופיים הוא סדרה של שלוש סיכות ראש, השני כולל פסאודוקנוט. מבנה זה גורם לוויסות תרגום של חלבון S15. רק שתי סיכות השיער האחרונות נשמרות במינים אחרים. דוגמה נוספת לחיידקים נחזה ב- Flavobacteria. המבנה המשני של המנהיג הריבוזומלי המשוער שלו מורכב מסיכת ראש ברוב המינים. עם זאת, למינים מסוימים אין סיכת ראש זו. חוסר כזה של מבנה משני לכאורה יהיה יוצא דופן עבור מנהיג ריבוזמלי, מה שהופך את המנהיג הריבוזומלי המועמד הזה לתחזית פחות וודאית. נצפו שתי דוגמאות בארכאה (אחת ב-Halobacteria ואחת ב- Methanomicrobia). במבנה זה התגלו קווי דמיון בין אתר הקישור ל-rRNA של החלבון הריבוזומלי S15 לבין אתר הקישור של מוביל החלבון הריבוזומלי S15. זה מצביע על כך שהמנהיגים הריבוזומליים באורגניזמים אלה מתפקדים על ידי חיקוי אתר הקישור S15 ב-rRNA.
Ribosomal_frameshift/Ribosomal frameshift:
המרת מסגרת ריבוזומלית, הידועה גם כ-Translational Frameshifting או Translational recoding, היא תופעה ביולוגית המתרחשת במהלך התרגום שגורמת לייצור של חלבונים מרובים וייחודיים מ-mRNA בודד. התהליך יכול להיות מתוכנת על ידי רצף הנוקלאוטידים של ה-mRNA ולעיתים מושפע ממבנה ה-mRNA המשני, התלת מימדי. זה תואר בעיקר בווירוסים (במיוחד רטרו-וירוסים), רטרוטרנספוזונים ואלמנטים של החדרת חיידקים, וגם בחלק מהגנים התאיים.
אנליזה_ריבוזומלית_בין-גנית/ניתוח מרווחים בין-גניים:
ניתוח מרווחים בין-גניים של RNA (rRNA) (RISA) היא שיטה לניתוח קהילה מיקרוביאלית המספקת אמצעי להשוואת סביבות שונות או השפעות טיפוליות ללא ההטיה המוטלת על ידי גישות התלויות בתרבות. RISA כרוכה בהגברת PCR של אזור של אופרון הגן rRNA בין תת-היחידות הקטנות (16S) והגדולות (23S) הנקראות אזור ה-spacer intergenic ISR. על ידי שימוש בפריימרים של אוליגונוקלאוטידים המכוונים לאזורים משומרים בגנים 16S ו-23S, ניתן להשתמש במקטעי RISA נוצר מרוב החיידקים הדומיננטיים בדגימה סביבתית. בעוד שרוב האופרון rRNA משרת פונקציה מבנית, חלקים מהאזור הבין-גני 16S-23S יכולים לקודד tRNAs בהתאם למין החיידק. עם זאת, הערך הטקסונומי של ISR טמון בהטרוגניות המשמעותית הן באורך והן ברצף הנוקלאוטידים. ב-RISA, אנו מנסים לנצל את ההטרוגניות באורך של ה-ISR, שהוכח כי היא נעה בין 150 ל-1500 bp, כאשר רוב אורכי ה-ISR נעים בין 150 ל-500 bp. תוצר ה-PCR שיתקבל יהיה תערובת של שברים שנתרמו על ידי מספר חברי קהילה דומיננטיים. מוצר זה עובר אלקטרופורזה בג'ל פוליאקרילאמיד, וה-DNA מוצג לאחר צביעה. התוצאה היא דפוס רצועות מורכב המספק פרופיל ספציפי לקהילה, כאשר כל רצועת DNA תואמת לאוכלוסיית חיידקים במכלול המקורי.
Ribosomal_modification_protein_rimk_like_family_member_b/Ribosomal modification protein rimk like member family b:
חלבון שינוי ריבוזומלי rimK כמו בן משפחה B הוא חלבון שבבני אדם מקודד על ידי הגן RIMKLB.
Ribosomal_pause/השהיה ריבוזומית:
הפסקה ריבוזומלית מתייחסת לתור או הערימה של ריבוזומים במהלך תרגום רצף הנוקלאוטידים של תעתיקי mRNA. תעתיקים אלה מפוענחים ומומרים לרצף חומצות אמינו במהלך סינתזת חלבון על ידי ריבוזומים. עקב אתרי ההשהיה של כמה mRNA's, נגרמת הפרעה בתרגום. הפסקה ריבוזומלית מתרחשת גם באוקריוטים וגם בפרוקריוטים. הפסקה חמורה יותר ידועה כדוכן ריבוזומלי. ידוע מאז שנות ה-80 ש-mRNA שונים מתורגמים בקצבים שונים. הסיבה העיקרית להבדלים הללו נחשבה לריכוז של זנים של tRNA נדירים המגבילים את הקצב שבו ניתן לפענח כמה תמלילים. עם זאת, עם טכניקות מחקר כמו פרופיל ריבוזום, נמצא שבאתרים מסוימים היו ריכוזים גבוהים יותר של ריבוזומים מהממוצע, ואתרי הפסקה אלו נבדקו עם קודונים ספציפיים. לא נמצא קשר בין התפוסה של קודונים ספציפיים לכמות ה-tRNA שלהם. לפיכך, הממצאים המוקדמים לגבי tRNA נדירים הגורמים לאתרי הפסקה אינם נראים סבירים. שתי טכניקות יכולות לאתר את אתר ההשהיה הריבוזומלית in vivo; בדיקת הגנה מיקרוקוקלית ובידוד של תמלול פוליזומלי. בידוד של תעתיקים פוליזומיים מתרחש על ידי צנטריפוגה של תמציות רקמה דרך כרית סוכרוז עם מעכבי התארכות תרגום, למשל cycloheximide. ניתן לזהות הפסקת ריבוזום במהלך סינתזת פרפרולקטין על פוליזומים חופשיים, כאשר הריבוזום מושהה, הריבוזומים האחרים מוערמים היטב יחדיו. כאשר הריבוזום עוצר, במהלך התרגום, השברים שהתחילו לתרגם לפני שההפסקה התרחשה מיוצגים יתר על המידה. עם זאת, יחד עם ה-mRNA אם הריבוזום עוצר אז פסים ספציפיים ישתפרו בקצה האחורי של הריבוזום. חלק ממעכבי ההתארכות, כגון: ציקלוהקסימיד (באאוקריוטים) או כלורמפניקול, גורמים לריבוזומים להשהות ולהצטבר ב קודוני ההתחלה. Elongation Factor P מווסת את ההפסקה הריבוזמית בפוליפרולין בחיידקים, וכאשר אין EFP צפיפות הריבוזומים יורדת ממוטי הפוליפרולין. אם יש הפסקות ריבוזומים מרובות, ה-EFP לא יפתור את זה.
חלבון ריבוזומלי/חלבון ריבוזומלי:
חלבון ריבוזומלי (r-protein או rProtein) הוא כל אחד מהחלבונים המרכיבים, בשילוב עם rRNA, את תת-היחידות הריבוזומליות המעורבות בתהליך התרגום התאי. לאי-קולי, לחיידקים אחרים ולארכיאה יש תת-יחידה קטנה ב-30S ותת-יחידה גדולה ב-50S, ואילו לבני אדם ולשמרים יש תת-יחידה קטנה ב-40S ותת-יחידה גדולה ב-60S. תת-יחידות שוות ממוספרות לעתים קרובות באופן שונה בין חיידקים, ארכאים, שמרים ובני אדם. חלק גדול מהידע על מולקולות אורגניות אלו הגיע מחקר הריבוזומים של E. coli. כל החלבונים הריבוזומליים בודדו ונוגדנים ספציפיים רבים נוצרו. אלה, יחד עם מיקרוסקופיה אלקטרונית ושימוש בתגובתיים מסוימים, אפשרו את קביעת הטופוגרפיה של החלבונים בריבוזום. לאחרונה, תמונה כמעט מלאה (קרוב) אטומית של החלבונים הריבוזומליים עולה מנתוני cryo-EM העדכניים ביותר ברזולוציה גבוהה (כולל PDB: 5AFI).
Ribosomal_protein_L10_leader/Ribosomal_protein L10 leader:
משפחה זו היא מבנה אוטו-וויסותי מוביל חלבון ריבוזומלי משוער המצוי ב-B. subtilis ובחיידקים אחרים בעלי רמת GC נמוכה. הוא ממוקם באזורים הבלתי מתורגמים של 5′ של mRNA המקודדים לחלבונים ריבוזומליים L10 ו-L12 (rplJ-rplL). מבנה מסיים שעתוק ללא תלות ב-Rho שכנראה מעורב ברגולציה כלול בקצה ה-3. מובילי חלבון ריבוזומליים אחרים שזוהו באותו מחקר כוללים את אלו של L13, L19, L20 ו-L21.
Ribosomal_protein_L13_leader/Ribosomal_protein L13 leader:
מובילי חלבון ריבוזומים L13 ממלאים תפקיד בביוגנזה של ריבוזום כחלק ממנגנון אוטו-וויסותי לבקרת ריכוז החלבונים הריבוזומים L13. שלוש מחלקות מבניות של מובילי חלבון ריבוזומליים L13 זוהו על ידי גישות ביואינפורמטיקה שונות: ב-B. subtilis ובחיידקים אחרים בעלי רמת GC נמוכה, ב-E. coli וב-Bacteroidia. למרות ש-RNAs אלו צפויים לבצע את אותה פונקציה ביולוגית, נראה שהם אינם קשורים זה לזה מבחינה מבנית. הדוגמה של E. coli אושרה בניסוי, אם כי הניסויים אינם מקיפים. שני מבני המנהיג האחרים אינם מבוססים עד כה על תמיכה ניסיונית.
Ribosomal_protein_L19_leader/Ribosomal_protein L19 leader:
מובילי חלבון ריבוזומים L19 הם חלק מהביוגנזה של הריבוזום. הם משמשים כמנגנון אוטו-וויסותי לשליטה בריכוז החלבונים הריבוזומליים L19, וממוקמים באזורי 5′ הלא מתורגמים של mRNA המקודדים לחלבון ריבוזומלי L19 (rplS). מובילי חלבון ריבוזומליים L19 נחזו ביואינפורמטיבית ב-B. subtilis ובחיידקים אחרים בעלי רמה נמוכה של GC ב-Bacillota. דוגמאות נוספות שחולקות מבנה דומה נחזו ב- Flavobacteria, גם באמצעות גישות ביואינפורמטיות.
Ribosomal_protein_L20_leader/Ribosomal protein L20 leader:
מנהיג חלבון ריבוזום L20 הוא מנהיג חלבון ריבוזום המעורב בביוגנזה של הריבוזום. הוא משמש כמנגנון אוטומטי לשליטה בריכוז החלבונים הריבוזומליים L20. המבנה ממוקם בדרך כלל באזורי 5′ הלא מתורגמים של mRNA המקודדים ל-initiation factor 3 ואחריהם חלבונים ריבוזומליים L35 ו-L20 (infC-rpmI-rplT), אך ה-mRNA המוסדרים מכילים תמיד גן L20. מבנה מסיים שעתוק ללא תלות ב-Rho שככל הנראה מעורב בוויסות כלול בקצה ה-3' בדוגמאות רבות של מובילי חלבון ריבוזומליים L20. שלוש צורות שונות מבנית של מנהיגי L20 הוקמו בניסוי. מוטיב מנהיג אחד כזה מופיע ב-Bacillota והשניים האחרים נמצאים ב-Gammaproteobacteria. מבין השניים האחרונים, אחד נמצא במגוון רחב של Gammaproteobacteria, בעוד השני מדווח רק ב-Escherichia coli. כל שלושת סוגי הלידרים מציגים קווי דמיון ברורים לאזור של RNA Ribosomal שאליו חלבון L20 נקשר בדרך כלל. עם זאת, במונחים של מבנה משני של RNA, ההקשר של האזור הדומה שונה בכל סוג מנהיג. דוגמה רביעית של מנהיג חלבון ריבוזומי L20 נחזה ב-Deltaproteobacteria באמצעות גישות ביואינפורמטיות. כמו שלושת סוגי המנהיגים שאושרו בניסוי, הגרסה של Deltaproteobacterial דומה לחלק הרלוונטי של RNA ריבוזומלי, אך מציגה דמיון זה בהקשר מבני נוסף.
Ribosomal_protein_L21_leader/Ribosomal_protein L21 leader:
מנהיג חלבון ריבוזמלי L21 הוא מבנה אוטו-וויסותי של מנהיג חלבון ריבוזמלי המווסת mRNA המכילים גן המקודד חלבון ריבוזמלי L21. מוטיב RNA נחזה לתפקד כמוביל L21 במחקר ביואינפורמטיקה, והוא נמצא ב-B. subtilis ובחיידקים אחרים בעלי רמה נמוכה של GC ב-Bacillota. הוא ממוקם באזורי 5′ הלא מתורגמים של mRNA המקודדים לחלבון ריבוזומלי L21, חלבון בעל תפקוד לא ידוע, וחלבון ריבוזומלי L27 (rplU-ysxB-rpmA).
Ribosomal_protein_S6/Ribosomal_protein S6:
חלבון ריבוזומלי S6 (rpS6 או eS6) הוא מרכיב של תת-היחידה הריבוזומלית 40S ולכן הוא מעורב בתרגום. מחקרים של מודל עכברים הראו שזרחון של eS6 מעורב בוויסות גודל התא, שגשוג תאים והומיאוסטזיס של גלוקוז. מחקרים מראים שהחלבון הריבוזומי p70 S6 קינאז (S6K1 ו-S6K2) ו-p90 חלבון ריבוזומלי S6 קינאז (RSK) שניהם זרחנים eS6 וכי S6K1 ו-S6K2 שולטים בפונקציה זו. נתיבים המובילים להשראת זרחון eS6 אנושי נמצאו כמגבירים את סינתזת חלבון IL-8. מנגנון זה תלוי ברצפים פרוקסימליים עשירים ב-A/U (APS) שנמצאו ב-3'UTR של IL-8 מיד לאחר קודון העצירה.
Ribosomal_protein_SA/Ribosomal protein SA:
חלבון ריבוזומלי 40S SA הוא חלבון ריבוזמלי שבבני אדם מקודד על ידי הגן RPSA. הוא פועל גם כקולטן משטח התא, במיוחד עבור למינין, ומעורב במספר תהליכים פתוגניים.
מנהיג חלבון ריבוזומלי/מוביל חלבון ריבוזומי:
מוביל חלבון ריבוזום הוא מנגנון המשמש בתאים כדי לשלוט בריכוז התאי של חלבון המהווה חלק מהריבוזום, ולוודא שהריכוז לא גבוה מדי ולא נמוך מדי. מובילי חלבון ריבוזומליים הם רצפי RNA שהם חלק מה-5' UTR של mRNA המקודדים לחלבון ריבוזומלי. כאשר הריכוזים התאיים של החלבון הריבוזומלי גבוהים, עודף חלבון ייקשר למנהיג ה-mRNA. אירוע קשירה זה יכול להוריד את ביטוי הגנים באמצעות מספר מנגנונים; לדוגמה, במצב קשור לחלבון, ה-RNA יכול ליצור לולאת גזע של סיום שעתוק פנימי. כאשר הריכוזים התאיים של החלבון הריבוזום אינם גבוהים, הם תפוסים בריבוזום, ואינם זמינים בכמויות משמעותיות לקשירת מוביל ה-mRNA. זה מוביל לביטוי מוגבר של הגן, מה שמוביל לסינתזה של יותר עותקים של החלבון הריבוזומלי. דוגמאות רבות למובילי חלבון ריבוזומליים ידועות בחיידקים, כולל מנהיג חלבון ריבוזומלי L20 ומנהיג ריבוזום S15. מובילים ריבוזומליים קושרים בדרך כלל חלבונים ריבוזומליים הקושרים בדרך כלל RNA ריבוזומלי. במקרים רבים, אתר הקישור בתוך המנהיג דומה מבחינה מבנית לאזור ה-RNA הריבוזומלי אליו נקשר החלבון, בדוגמה של חיקוי מולקולרי.
גורם ההצלה_ריבוזומלי/גורם הצלה ריבוזומי:
גורם הצלה ריבוזומי עשוי להתייחס ל: גורם הצלה ריבוזום חלופי A גורם הצלה ריבוזום חלופי B
Ribosomal_s6_kinase/Ribosomal s6 kinase:
בביולוגיה מולקולרית, ribosomal s6 kinase (rsk) הוא משפחה של קינאז חלבון המעורב בהולכת אותות. ישנן שתי תת-משפחות של rsk, p90rsk, הידוע גם בשם MAPK-activated protein kinase-1 (MAPKAP-K1), ו-p70rsk, הידוע גם בשם S6-H1 Kinase או פשוט S6 Kinase. ישנן שלוש גרסאות של p90rsk בבני אדם, rsk 1-3. Rsks הם serine/threonine kinases ומופעלים על ידי מסלול MAPK/ERK. ישנם שני הומולוגים יונקים ידועים של S6 Kinase: S6K1 ו-S6K2.
טרנסלוקציה_ריבוזומית/טרנסלוקציה ריבוזומלית:
טרנסלוקציה ריבוזומלית מתרחשת בהתארכות של חלבון ב: תרגום אוקריוטי § תרגום חיידקי התארכות § התארכות תרגום ארכאי